284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2027 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2027  hypothetical protein  100 
 
 		 539 aa  1010    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3021  virulence factor MVIN family protein  60.04 
 
 		 540 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.378839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2175  virulence factor MVIN family protein  52.16 
 
 		 527 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6052  membrane protein putative virulence factor-like protein  45.88 
 
 		 549 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2007  virulence factor MVIN family protein  49.89 
 
 		 552 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.4064  normal  0.087601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  46.83 
 
 		 541 aa  298  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  43.79 
 
 		 648 aa  286  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  43.27 
 
 		 538 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3143  virulence factor MVIN family protein  42.67 
 
 		 532 aa  229  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0110938  normal  0.770926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1346  virulence factor MVIN family protein  38.67 
 
 		 557 aa  219  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.817252  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  43.8 
 
 		 964 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1130  virulence factor MVIN family protein  39.39 
 
 		 538 aa  210  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1908  virulence factor MVIN family protein  40.31 
 
 		 567 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146225  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1663  virulence factor MVIN family protein  41.97 
 
 		 541 aa  194  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.45805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1917  virulence factor MVIN family protein  41.27 
 
 		 568 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.731846  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13710  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  36.53 
 
 		 588 aa  178  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.721621  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  34.59 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  30.8 
 
 		 559 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  29.47 
 
 		 657 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.79 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  29.71 
 
 		 526 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  29.63 
 
 		 700 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  29.59 
 
 		 1217 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  27.74 
 
 		 610 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  31.71 
 
 		 541 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  32.2 
 
 		 535 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  32.2 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  25.31 
 
 		 563 aa  111  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  28.38 
 
 		 532 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  28.99 
 
 		 627 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  27.03 
 
 		 621 aa  110  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  27.57 
 
 		 521 aa  109  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  30.51 
 
 		 674 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  32.11 
 
 		 535 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  28.11 
 
 		 544 aa  109  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  28.89 
 
 		 529 aa  107  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  32.62 
 
 		 535 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  28.09 
 
 		 534 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  28.67 
 
 		 560 aa  102  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  26.46 
 
 		 568 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  29.16 
 
 		 570 aa  100  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  25.41 
 
 		 521 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  28.16 
 
 		 708 aa  99.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  26.47 
 
 		 552 aa  96.3  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  30.57 
 
 		 580 aa  95.9  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  26.55 
 
 		 511 aa  95.5  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  32.49 
 
 		 552 aa  94  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  25.83 
 
 		 512 aa  94  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  26.11 
 
 		 511 aa  94  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  26.11 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  26.11 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  26.11 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  26.11 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  27.06 
 
 		 715 aa  92.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  25.88 
 
 		 511 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  25.88 
 
 		 511 aa  92.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  25.88 
 
 		 511 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  25.88 
 
 		 511 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  25.88 
 
 		 511 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  30.19 
 
 		 918 aa  92  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  24.28 
 
 		 575 aa  90.5  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  24.01 
 
 		 519 aa  90.1  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  28.05 
 
 		 1209 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  26.36 
 
 		 511 aa  89.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  26.36 
 
 		 542 aa  89.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  27.76 
 
 		 1224 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  28.74 
 
 		 614 aa  89  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  26.11 
 
 		 524 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  26.11 
 
 		 524 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  26.11 
 
 		 524 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  26.11 
 
 		 524 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  26.11 
 
 		 524 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  25.3 
 
 		 511 aa  88.6  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  27.32 
 
 		 523 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 		 1263 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  25.33 
 
 		 512 aa  87  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  26.64 
 
 		 511 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  27.53 
 
 		 512 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  31.63 
 
 		 535 aa  86.7  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  28.3 
 
 		 1184 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  28.3 
 
 		 1168 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  26.26 
 
 		 528 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  27.62 
 
 		 512 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  27.46 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  26.1 
 
 		 512 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  25.77 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  25.39 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  25.77 
 
 		 512 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  27.07 
 
 		 513 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  25.7 
 
 		 514 aa  83.6  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0532  integral membrane protein MviN  27.3 
 
 		 516 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  26.16 
 
 		 565 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  26.04 
 
 		 511 aa  83.2  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  25.18 
 
 		 539 aa  83.2  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  24.87 
 
 		 524 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  25.6 
 
 		 511 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  23.58 
 
 		 511 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  26.46 
 
 		 569 aa  82.4  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  22.9 
 
 		 519 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>