295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1130 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1130  virulence factor MVIN family protein  100 
 
 
538 aa  1017    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  49.91 
 
 
964 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1346  virulence factor MVIN family protein  46.99 
 
 
557 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.817252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  47.63 
 
 
538 aa  319  6e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6052  membrane protein putative virulence factor-like protein  40.42 
 
 
549 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612093  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2175  virulence factor MVIN family protein  42.68 
 
 
527 aa  289  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  42.38 
 
 
648 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1663  virulence factor MVIN family protein  44.07 
 
 
541 aa  248  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.45805  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2007  virulence factor MVIN family protein  41.46 
 
 
552 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.4064  normal  0.087601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  41.03 
 
 
541 aa  233  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13710  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  39.75 
 
 
588 aa  229  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.721621  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2027  hypothetical protein  39.43 
 
 
539 aa  217  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3021  virulence factor MVIN family protein  40.53 
 
 
540 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.378839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1908  virulence factor MVIN family protein  41.73 
 
 
567 aa  194  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146225  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1917  virulence factor MVIN family protein  40.86 
 
 
568 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.731846  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3143  virulence factor MVIN family protein  39.87 
 
 
532 aa  183  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0110938  normal  0.770926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  34.86 
 
 
517 aa  139  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  31.39 
 
 
544 aa  119  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  30.18 
 
 
533 aa  113  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  29.77 
 
 
526 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  28.83 
 
 
534 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.4 
 
 
563 aa  108  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  28.31 
 
 
559 aa  107  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  31.53 
 
 
657 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  28.93 
 
 
674 aa  104  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  27.81 
 
 
532 aa  103  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 
918 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  31.09 
 
 
535 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  31.48 
 
 
535 aa  99.8  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  29.41 
 
 
1217 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  28.78 
 
 
610 aa  98.2  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  25.38 
 
 
700 aa  98.2  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  27.94 
 
 
552 aa  97.4  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  25.78 
 
 
521 aa  93.2  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  28.5 
 
 
570 aa  92  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  27.99 
 
 
580 aa  90.5  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  27.74 
 
 
569 aa  90.5  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  25.44 
 
 
575 aa  89.4  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  28.54 
 
 
516 aa  87.4  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  28.22 
 
 
534 aa  84.7  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  26.58 
 
 
568 aa  84.3  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  25 
 
 
613 aa  84  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  30.63 
 
 
621 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  27.7 
 
 
565 aa  82.4  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  28.32 
 
 
552 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  27.17 
 
 
899 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 
535 aa  80.9  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  24.69 
 
 
627 aa  80.9  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  26.12 
 
 
546 aa  80.9  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  27.07 
 
 
494 aa  80.5  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  28.12 
 
 
715 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  27.07 
 
 
560 aa  79  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  27.8 
 
 
517 aa  77.4  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  29.27 
 
 
520 aa  77.4  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  25.55 
 
 
529 aa  76.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  28.67 
 
 
708 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  26.68 
 
 
521 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0532  integral membrane protein MviN  28.21 
 
 
516 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  25.8 
 
 
523 aa  73.9  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  26.22 
 
 
1219 aa  73.9  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  27.69 
 
 
517 aa  73.6  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  21.84 
 
 
598 aa  73.9  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  25.56 
 
 
515 aa  72.8  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  30.48 
 
 
511 aa  72.8  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  23.27 
 
 
549 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  26.93 
 
 
532 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  26.82 
 
 
521 aa  72  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  28.67 
 
 
513 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  25.11 
 
 
545 aa  70.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  27.34 
 
 
573 aa  70.5  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  27.46 
 
 
530 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0760  virulence factor MVIN-like  27.04 
 
 
516 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1472  integral membrane protein MviN  27.86 
 
 
517 aa  69.7  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  28.68 
 
 
513 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  28.34 
 
 
511 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 
511 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  27.23 
 
 
665 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 
511 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  28.34 
 
 
511 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 
511 aa  68.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  28.32 
 
 
513 aa  68.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 
511 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 
511 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 
511 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3202  integral membrane protein MviN  26.48 
 
 
516 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945737  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 
511 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  27.43 
 
 
521 aa  68.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0342  integral membrane protein MviN  23.48 
 
 
537 aa  68.2  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3077  integral membrane protein MviN  28.62 
 
 
543 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000112933  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  26.45 
 
 
533 aa  68.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  27.97 
 
 
514 aa  68.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  28.75 
 
 
513 aa  67.4  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  29.22 
 
 
512 aa  67.4  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  25 
 
 
515 aa  67  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  26.94 
 
 
524 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  25.31 
 
 
521 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  26.23 
 
 
530 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  26.94 
 
 
524 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  26.94 
 
 
524 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  26.94 
 
 
524 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>