More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4797 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 665 aa  1282    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  41.82 
 
 		 899 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  40.26 
 
 		 559 aa  320  5e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  35.58 
 
 		 627 aa  280  6e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  38.26 
 
 		 552 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  36.04 
 
 		 534 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  37.98 
 
 		 621 aa  270  7e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  40.08 
 
 		 570 aa  268  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  37.87 
 
 		 532 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  39.6 
 
 		 674 aa  266  7e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  36.42 
 
 		 708 aa  260  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  36.92 
 
 		 568 aa  257  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  35.91 
 
 		 657 aa  253  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  34.33 
 
 		 918 aa  252  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  36.8 
 
 		 715 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  36.43 
 
 		 526 aa  250  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  37.57 
 
 		 580 aa  249  9e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  40.25 
 
 		 533 aa  247  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  37.55 
 
 		 560 aa  242  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  35.17 
 
 		 565 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  33.88 
 
 		 1217 aa  236  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  36.58 
 
 		 1652 aa  234  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  39.33 
 
 		 535 aa  227  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  35.38 
 
 		 610 aa  227  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  36.73 
 
 		 614 aa  219  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  32.74 
 
 		 552 aa  216  8e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  33.75 
 
 		 569 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  34.27 
 
 		 521 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  33.63 
 
 		 1219 aa  201  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  34.09 
 
 		 580 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  33.73 
 
 		 1209 aa  196  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  34.09 
 
 		 1224 aa  194  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  32.93 
 
 		 579 aa  193  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  33.28 
 
 		 592 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  31.51 
 
 		 598 aa  187  8e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  32.27 
 
 		 1184 aa  186  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  31.77 
 
 		 1219 aa  186  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  31.13 
 
 		 575 aa  184  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  29.95 
 
 		 546 aa  180  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  33.91 
 
 		 1263 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 1184 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 1168 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  30.06 
 
 		 535 aa  132  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  32.2 
 
 		 517 aa  130  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  26.83 
 
 		 563 aa  119  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  29.28 
 
 		 522 aa  118  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  25.63 
 
 		 700 aa  118  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  28.94 
 
 		 511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  31.01 
 
 		 513 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  31.01 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  25.7 
 
 		 539 aa  111  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  27.52 
 
 		 545 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  29.28 
 
 		 513 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  27.81 
 
 		 573 aa  108  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  27.21 
 
 		 613 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.72 
 
 		 535 aa  107  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2529  integral membrane protein MviN  24.59 
 
 		 537 aa  108  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  26.76 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  31.91 
 
 		 543 aa  104  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  25.17 
 
 		 521 aa  103  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  27.41 
 
 		 511 aa  102  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  25.6 
 
 		 549 aa  101  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  24.61 
 
 		 534 aa  101  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  25.58 
 
 		 511 aa  100  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  26.37 
 
 		 511 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  30.86 
 
 		 534 aa  100  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1296  integral membrane protein MviN  26.13 
 
 		 538 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  27.15 
 
 		 526 aa  99.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  27.35 
 
 		 521 aa  99  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  26.14 
 
 		 514 aa  99  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  26.83 
 
 		 511 aa  99  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  27.61 
 
 		 532 aa  99  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  26.8 
 
 		 555 aa  99.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  27.27 
 
 		 529 aa  99  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  27.57 
 
 		 512 aa  98.6  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  24.55 
 
 		 521 aa  98.6  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  27.47 
 
 		 517 aa  98.6  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  27.93 
 
 		 521 aa  98.6  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  25.4 
 
 		 534 aa  98.6  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 		 524 aa  98.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 		 524 aa  98.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 		 524 aa  98.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 		 524 aa  98.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 		 524 aa  98.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  27.4 
 
 		 517 aa  97.4  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  27.08 
 
 		 516 aa  97.1  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  26.41 
 
 		 513 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  27.5 
 
 		 521 aa  96.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  25.47 
 
 		 518 aa  97.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  26.55 
 
 		 511 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  26.55 
 
 		 511 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  26.55 
 
 		 511 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  27.16 
 
 		 511 aa  95.5  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  27.7 
 
 		 528 aa  96.3  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  26.61 
 
 		 519 aa  95.9  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  26.55 
 
 		 511 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  26.99 
 
 		 530 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  26 
 
 		 522 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 		 511 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 		 511 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>