More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4226 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  100 
 
 		 1219 aa  2414    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  41.61 
 
 		 1263 aa  714    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  41.56 
 
 		 1209 aa  726    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  41.54 
 
 		 1184 aa  715    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  41.84 
 
 		 1224 aa  737    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  41.09 
 
 		 1184 aa  720    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  41.94 
 
 		 1168 aa  717    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  47.33 
 
 		 1219 aa  991    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  30.51 
 
 		 1217 aa  403  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  41.4 
 
 		 610 aa  357  6.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  42.29 
 
 		 521 aa  347  8.999999999999999e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  42.92 
 
 		 674 aa  292  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  32.8 
 
 		 918 aa  232  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  32.93 
 
 		 657 aa  228  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  32.1 
 
 		 534 aa  225  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  32.96 
 
 		 526 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  31.17 
 
 		 532 aa  209  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  30.64 
 
 		 899 aa  204  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  34.04 
 
 		 546 aa  200  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  34.01 
 
 		 580 aa  198  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  33.6 
 
 		 592 aa  196  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  34.7 
 
 		 533 aa  193  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  30.58 
 
 		 621 aa  192  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  31.37 
 
 		 559 aa  191  8e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  36.16 
 
 		 535 aa  185  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  30.35 
 
 		 627 aa  184  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7083  hypothetical protein  32.57 
 
 		 502 aa  181  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  31.09 
 
 		 568 aa  177  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  32.92 
 
 		 570 aa  174  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39640  hypothetical protein  29.34 
 
 		 509 aa  173  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  33.89 
 
 		 560 aa  173  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3873  serine/threonine protein kinase  56.46 
 
 		 545 aa  167  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  31.98 
 
 		 665 aa  155  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  29.2 
 
 		 580 aa  152  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0037  hypothetical protein  40.28 
 
 		 623 aa  147  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0046  hypothetical protein  40.28 
 
 		 623 aa  147  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847244 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  30.23 
 
 		 552 aa  145  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0027  hypothetical protein  39.58 
 
 		 623 aa  144  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.476694 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  26.67 
 
 		 700 aa  139  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  28.73 
 
 		 1652 aa  137  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  26.88 
 
 		 715 aa  128  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  28.14 
 
 		 708 aa  127  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.82 
 
 		 563 aa  124  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  27.13 
 
 		 552 aa  123  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  28.33 
 
 		 575 aa  120  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  25.57 
 
 		 544 aa  116  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  31.87 
 
 		 535 aa  116  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  27.11 
 
 		 598 aa  114  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  25.74 
 
 		 535 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  25.91 
 
 		 565 aa  112  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  27.27 
 
 		 523 aa  106  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  27.92 
 
 		 614 aa  105  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  27.68 
 
 		 539 aa  103  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  25.46 
 
 		 505 aa  103  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  28.37 
 
 		 529 aa  102  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  27.23 
 
 		 579 aa  99.8  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  27.13 
 
 		 569 aa  99.8  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  27.79 
 
 		 512 aa  95.9  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  28.97 
 
 		 517 aa  95.5  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6434  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 		 477 aa  95.1  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  26.68 
 
 		 511 aa  92.4  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  27.27 
 
 		 511 aa  92  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 		 512 aa  91.7  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  28.16 
 
 		 511 aa  91.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  26.19 
 
 		 511 aa  90.9  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  28.16 
 
 		 511 aa  91.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  28.16 
 
 		 511 aa  91.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  28.16 
 
 		 511 aa  91.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  28.16 
 
 		 511 aa  91.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  27.92 
 
 		 511 aa  90.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  27.92 
 
 		 511 aa  90.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  27.63 
 
 		 512 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  27.92 
 
 		 511 aa  90.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  27.92 
 
 		 511 aa  90.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  28.83 
 
 		 521 aa  89.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  27.63 
 
 		 512 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  26.56 
 
 		 524 aa  89  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  26.56 
 
 		 524 aa  89  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  26.56 
 
 		 524 aa  89  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  26.56 
 
 		 524 aa  89  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  26.56 
 
 		 524 aa  89  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  24.34 
 
 		 535 aa  89  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  30.55 
 
 		 541 aa  89  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  27.44 
 
 		 512 aa  88.6  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  27.06 
 
 		 648 aa  88.2  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2529  integral membrane protein MviN  24.04 
 
 		 537 aa  87.8  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  26.82 
 
 		 528 aa  87.8  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  27.21 
 
 		 513 aa  87.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  24.9 
 
 		 519 aa  87  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  24.71 
 
 		 523 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  25.93 
 
 		 521 aa  87.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  26.82 
 
 		 498 aa  86.3  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  26.62 
 
 		 534 aa  86.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  25.62 
 
 		 534 aa  86.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  25.5 
 
 		 522 aa  85.1  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  28.43 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  24.73 
 
 		 521 aa  84.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0195  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 		 595 aa  84.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  27.4 
 
 		 525 aa  83.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  26.38 
 
 		 509 aa  84  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>