More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4497 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 570 aa  1099    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  48.47 
 
 		 580 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  41.81 
 
 		 565 aa  361  3e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  45.36 
 
 		 1652 aa  358  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  44.52 
 
 		 560 aa  340  2.9999999999999998e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  40.33 
 
 		 552 aa  336  7.999999999999999e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  40.22 
 
 		 708 aa  315  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  41.29 
 
 		 715 aa  313  7.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  38.76 
 
 		 575 aa  293  5e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  35.76 
 
 		 598 aa  287  2.9999999999999996e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  38.52 
 
 		 569 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  37.8 
 
 		 614 aa  268  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  40.79 
 
 		 559 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  38.38 
 
 		 579 aa  260  5.0000000000000005e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  37.31 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  38.53 
 
 		 532 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  35.37 
 
 		 899 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  40.37 
 
 		 657 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  38.59 
 
 		 526 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  35.87 
 
 		 534 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  39.22 
 
 		 621 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  39.33 
 
 		 665 aa  237  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  37.63 
 
 		 627 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  37.62 
 
 		 918 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  36.79 
 
 		 568 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  35.48 
 
 		 610 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  39.42 
 
 		 674 aa  217  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  37.68 
 
 		 535 aa  217  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  33.7 
 
 		 546 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  33.39 
 
 		 580 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  34.43 
 
 		 1217 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  34.04 
 
 		 592 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  33.64 
 
 		 533 aa  196  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  34.8 
 
 		 521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  33.75 
 
 		 1219 aa  180  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  34.75 
 
 		 1209 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  35.22 
 
 		 1224 aa  179  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  32.57 
 
 		 1219 aa  179  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  34.39 
 
 		 1184 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  34.55 
 
 		 1168 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  34.55 
 
 		 1184 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  34.55 
 
 		 1263 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  32.71 
 
 		 535 aa  138  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  28.12 
 
 		 700 aa  121  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  29.72 
 
 		 517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  25.79 
 
 		 563 aa  103  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  25.84 
 
 		 534 aa  103  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.88 
 
 		 535 aa  102  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  28.1 
 
 		 544 aa  101  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  25.14 
 
 		 521 aa  97.4  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  29.21 
 
 		 514 aa  97.4  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  27.88 
 
 		 526 aa  96.3  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  28.28 
 
 		 613 aa  94.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  29.93 
 
 		 513 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  29.47 
 
 		 513 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  31.5 
 
 		 541 aa  92  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1346  virulence factor MVIN family protein  29.7 
 
 		 557 aa  90.9  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.817252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  30.09 
 
 		 538 aa  88.6  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  27.65 
 
 		 521 aa  87.8  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  26.61 
 
 		 529 aa  87  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  28.1 
 
 		 511 aa  87  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2027  hypothetical protein  29.45 
 
 		 539 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  26.87 
 
 		 521 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  27.55 
 
 		 529 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  25.78 
 
 		 523 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13710  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  27.78 
 
 		 588 aa  85.9  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.721621  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 		 511 aa  85.1  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  26.88 
 
 		 648 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2175  virulence factor MVIN family protein  28.45 
 
 		 527 aa  84.7  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134074  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  26.76 
 
 		 555 aa  84  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  26.54 
 
 		 516 aa  84  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  28.86 
 
 		 513 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  28.91 
 
 		 512 aa  83.2  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  26.65 
 
 		 523 aa  83.2  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  28.22 
 
 		 525 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2003  integral membrane protein MviN  30.56 
 
 		 538 aa  82  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.965179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  26.42 
 
 		 529 aa  82.8  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2444  integral membrane protein MviN  29.01 
 
 		 548 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410377  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  25.93 
 
 		 539 aa  81.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  27.34 
 
 		 511 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  27.34 
 
 		 511 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  27.34 
 
 		 511 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  27.1 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  27.1 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  27.34 
 
 		 511 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  27.1 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  27.1 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  27.1 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  27.46 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  27.46 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  27.46 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  27.46 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  27.46 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  26.77 
 
 		 528 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  25.57 
 
 		 522 aa  80.5  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  26.65 
 
 		 511 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  25.62 
 
 		 521 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2529  integral membrane protein MviN  24.06 
 
 		 537 aa  79.3  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  24 
 
 		 508 aa  78.2  0.0000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>