More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7082 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  100 
 
 
521 aa  1013    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  51.06 
 
 
610 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  43.58 
 
 
1217 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  44.39 
 
 
1219 aa  352  8.999999999999999e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  47.92 
 
 
674 aa  350  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  42.29 
 
 
1219 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  45.34 
 
 
1224 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  41.37 
 
 
1184 aa  332  9e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  42.24 
 
 
1168 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  42.24 
 
 
1184 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  42.24 
 
 
1263 aa  326  6e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  44.12 
 
 
1209 aa  325  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  40.65 
 
 
592 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  38.91 
 
 
580 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  37.35 
 
 
534 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  39.8 
 
 
657 aa  256  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  35.64 
 
 
559 aa  243  6e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  35.71 
 
 
546 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  35.27 
 
 
918 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  35.81 
 
 
526 aa  237  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  35.06 
 
 
627 aa  236  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  32.34 
 
 
568 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  35.36 
 
 
621 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  36.07 
 
 
532 aa  230  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  37.47 
 
 
535 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  37.4 
 
 
533 aa  216  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  32.09 
 
 
552 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  34.53 
 
 
899 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  33.08 
 
 
580 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  32.45 
 
 
560 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  34.8 
 
 
570 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  34.27 
 
 
665 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  30.51 
 
 
565 aa  156  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  30.09 
 
 
552 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.39 
 
 
535 aa  151  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  31.45 
 
 
708 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  29.84 
 
 
715 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  32.81 
 
 
1652 aa  141  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  30 
 
 
614 aa  137  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.42 
 
 
563 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.46 
 
 
579 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  25.36 
 
 
523 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  28.76 
 
 
534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  27.87 
 
 
598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  28.12 
 
 
700 aa  130  8.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  28.42 
 
 
539 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  30.43 
 
 
535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  28.54 
 
 
575 aa  127  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  28.94 
 
 
569 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  30.5 
 
 
517 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 
522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  28.66 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1590  integral membrane protein MviN  25.9 
 
 
521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.814029  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  27.03 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  26.14 
 
 
511 aa  111  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  27.1 
 
 
544 aa  111  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  26.74 
 
 
526 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  26.12 
 
 
516 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  25 
 
 
505 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  25.45 
 
 
534 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  25.19 
 
 
523 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  26.98 
 
 
526 aa  108  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  26.4 
 
 
521 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  26.6 
 
 
517 aa  106  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  25.43 
 
 
511 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  28.06 
 
 
648 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  24.16 
 
 
512 aa  104  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  27.32 
 
 
521 aa  103  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  27.02 
 
 
521 aa  103  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  26.28 
 
 
525 aa  103  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  27.37 
 
 
521 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  26.43 
 
 
529 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  26 
 
 
534 aa  101  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  26.18 
 
 
519 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  24.74 
 
 
528 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  28.22 
 
 
517 aa  99  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  25.72 
 
 
543 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  23.91 
 
 
511 aa  98.6  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  23.68 
 
 
511 aa  97.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  26.52 
 
 
521 aa  96.7  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  27.15 
 
 
521 aa  96.7  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  27.11 
 
 
512 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0736  virulence factor MVIN family protein  28.88 
 
 
537 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  30.13 
 
 
545 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  25.22 
 
 
545 aa  95.5  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 
512 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  28.99 
 
 
541 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  24.4 
 
 
517 aa  94.4  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  24.4 
 
 
517 aa  94.4  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  24.06 
 
 
514 aa  94.4  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  24.14 
 
 
530 aa  94  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  20.86 
 
 
494 aa  94  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  25.96 
 
 
522 aa  93.6  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  26.65 
 
 
521 aa  93.6  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  27.63 
 
 
573 aa  93.6  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  26.74 
 
 
522 aa  93.6  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  25.46 
 
 
524 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  26.2 
 
 
513 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  25.46 
 
 
524 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  26.65 
 
 
532 aa  93.2  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>