More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5400 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 1217 aa  2402    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  32.71 
 
 		 1224 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  32.76 
 
 		 1168 aa  422  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  32.62 
 
 		 1263 aa  422  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  32.66 
 
 		 1184 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  32.83 
 
 		 1219 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  32.26 
 
 		 1184 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  30.41 
 
 		 1219 aa  405  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  44.78 
 
 		 610 aa  395  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  43.58 
 
 		 521 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  33.84 
 
 		 1209 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  44.97 
 
 		 674 aa  362  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  37.66 
 
 		 918 aa  313  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  38.34 
 
 		 621 aa  296  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  36.69 
 
 		 657 aa  296  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  37.93 
 
 		 627 aa  293  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  41.2 
 
 		 559 aa  281  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  38.25 
 
 		 526 aa  274  8.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  39.23 
 
 		 568 aa  270  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  40.04 
 
 		 534 aa  268  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  39.71 
 
 		 532 aa  267  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  39.18 
 
 		 592 aa  267  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  36.56 
 
 		 546 aa  265  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  42.46 
 
 		 533 aa  263  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  38.03 
 
 		 580 aa  261  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  40.8 
 
 		 535 aa  240  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  32.8 
 
 		 899 aa  235  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  36.01 
 
 		 580 aa  224  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  32.59 
 
 		 1652 aa  209  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  33.64 
 
 		 552 aa  206  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  32.72 
 
 		 715 aa  200  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  33.75 
 
 		 665 aa  197  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  34.29 
 
 		 560 aa  197  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  34.15 
 
 		 570 aa  195  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  33.69 
 
 		 708 aa  192  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39640  hypothetical protein  32.18 
 
 		 509 aa  185  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  31.34 
 
 		 552 aa  182  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  33.85 
 
 		 569 aa  175  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  30.24 
 
 		 575 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  31.58 
 
 		 614 aa  169  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  29.23 
 
 		 523 aa  167  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  32.38 
 
 		 565 aa  162  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7083  hypothetical protein  31.08 
 
 		 502 aa  155  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  27.41 
 
 		 700 aa  155  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  29.76 
 
 		 521 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  34.57 
 
 		 535 aa  149  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  28.06 
 
 		 598 aa  147  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  28.51 
 
 		 522 aa  144  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  30.85 
 
 		 528 aa  142  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  30.88 
 
 		 526 aa  141  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  30.95 
 
 		 526 aa  140  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  27.44 
 
 		 531 aa  140  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  30.74 
 
 		 579 aa  139  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  25.84 
 
 		 535 aa  137  9e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  34.48 
 
 		 517 aa  135  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  30.16 
 
 		 524 aa  132  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  26.17 
 
 		 544 aa  130  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  24.83 
 
 		 563 aa  129  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  26.56 
 
 		 505 aa  128  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  29.65 
 
 		 522 aa  128  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  26.67 
 
 		 524 aa  127  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  28.51 
 
 		 521 aa  127  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  28.77 
 
 		 518 aa  126  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  26.05 
 
 		 519 aa  127  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  25.96 
 
 		 519 aa  126  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  25.96 
 
 		 519 aa  126  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  25.96 
 
 		 519 aa  126  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  26.05 
 
 		 519 aa  126  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  25.96 
 
 		 519 aa  125  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  27.02 
 
 		 521 aa  124  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  28.94 
 
 		 530 aa  124  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  26.56 
 
 		 519 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  25.61 
 
 		 523 aa  124  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  29.1 
 
 		 529 aa  123  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  26.05 
 
 		 519 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  30.05 
 
 		 521 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  28.17 
 
 		 517 aa  123  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  26.08 
 
 		 519 aa  122  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 		 530 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 		 511 aa  121  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  26.16 
 
 		 519 aa  121  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  26.89 
 
 		 519 aa  121  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  26.76 
 
 		 520 aa  121  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  25.61 
 
 		 519 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  27.94 
 
 		 530 aa  120  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  27.38 
 
 		 539 aa  120  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  27.42 
 
 		 534 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  28.2 
 
 		 517 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  27.93 
 
 		 512 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  28.43 
 
 		 511 aa  119  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  25.27 
 
 		 519 aa  119  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  28.92 
 
 		 511 aa  119  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  26.39 
 
 		 521 aa  118  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  27.06 
 
 		 524 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  27.06 
 
 		 524 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  28.24 
 
 		 519 aa  117  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  27.06 
 
 		 524 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  27.06 
 
 		 524 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  27.06 
 
 		 524 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  27.7 
 
 		 512 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>