More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2545 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 552 aa  1086    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  61.96 
 
 		 565 aa  676    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  45.12 
 
 		 580 aa  420  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  45.07 
 
 		 569 aa  422  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  44.88 
 
 		 1652 aa  350  4e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  43.01 
 
 		 570 aa  331  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  36.1 
 
 		 598 aa  323  4e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  34.78 
 
 		 575 aa  310  4e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  34.38 
 
 		 560 aa  291  2e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  34.79 
 
 		 715 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  36.4 
 
 		 708 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  32.76 
 
 		 614 aa  251  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  34.82 
 
 		 552 aa  250  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  34.23 
 
 		 899 aa  243  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  32.91 
 
 		 534 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  30.65 
 
 		 579 aa  207  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  33.15 
 
 		 568 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  34.45 
 
 		 559 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  33.26 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  31.09 
 
 		 621 aa  200  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  29.23 
 
 		 580 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  31.64 
 
 		 627 aa  190  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  30.13 
 
 		 526 aa  188  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  29.96 
 
 		 546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  32.97 
 
 		 665 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  28.78 
 
 		 1217 aa  183  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  29.23 
 
 		 592 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  29.55 
 
 		 535 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  31.55 
 
 		 674 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  30.58 
 
 		 610 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  28.49 
 
 		 918 aa  164  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  29.71 
 
 		 657 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  30.09 
 
 		 521 aa  153  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  27.14 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  31.54 
 
 		 1219 aa  133  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.35 
 
 		 535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  27.13 
 
 		 1219 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  31.73 
 
 		 1168 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  27.35 
 
 		 563 aa  111  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  31.73 
 
 		 1263 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  31.73 
 
 		 1184 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  30.84 
 
 		 1224 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  30.7 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 		 1209 aa  105  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  28.65 
 
 		 1184 aa  104  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  24.45 
 
 		 539 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  27.36 
 
 		 526 aa  97.8  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  24.67 
 
 		 544 aa  96.3  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  22.98 
 
 		 523 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  23.35 
 
 		 534 aa  95.9  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  27.2 
 
 		 700 aa  95.1  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  25.24 
 
 		 522 aa  93.6  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  27.1 
 
 		 521 aa  93.6  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  27.1 
 
 		 532 aa  93.6  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  26.04 
 
 		 521 aa  91.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  26.5 
 
 		 520 aa  91.7  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  23.12 
 
 		 525 aa  91.3  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  27.23 
 
 		 511 aa  90.9  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 		 573 aa  90.1  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  26.57 
 
 		 521 aa  89.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  27.11 
 
 		 517 aa  89.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  22.86 
 
 		 521 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  23.61 
 
 		 521 aa  87.4  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  27.61 
 
 		 529 aa  86.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  28.53 
 
 		 541 aa  86.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  27.59 
 
 		 529 aa  86.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  26.94 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  22.62 
 
 		 526 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  28.49 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  27.88 
 
 		 555 aa  84.3  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  25.59 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1776  integral membrane protein MviN  27.16 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  24.53 
 
 		 545 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  26.19 
 
 		 522 aa  83.2  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  26.07 
 
 		 543 aa  82  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6052  membrane protein putative virulence factor-like protein  26.48 
 
 		 549 aa  82.8  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  27.04 
 
 		 545 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  25.9 
 
 		 541 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  36.93 
 
 		 522 aa  82  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  26.71 
 
 		 513 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  23.9 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  27.42 
 
 		 516 aa  80.9  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  24.88 
 
 		 524 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  24.88 
 
 		 524 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  24.88 
 
 		 524 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  24.88 
 
 		 524 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  24.88 
 
 		 524 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  25.99 
 
 		 513 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  26.39 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1130  virulence factor MVIN family protein  27.7 
 
 		 538 aa  79.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 		 613 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  33.86 
 
 		 521 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  26.18 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  26.18 
 
 		 511 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  25.64 
 
 		 521 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  26.18 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  26.18 
 
 		 511 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  26.18 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  20.95 
 
 		 549 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  26.18 
 
 		 511 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>