More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6435 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 546 aa  1070    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  49.43 
 
 		 592 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  49.16 
 
 		 580 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  38.18 
 
 		 534 aa  306  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  39.38 
 
 		 674 aa  296  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  40.29 
 
 		 559 aa  295  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  38.31 
 
 		 1217 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  35.41 
 
 		 610 aa  288  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  36.64 
 
 		 526 aa  280  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  35.75 
 
 		 627 aa  277  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  36.8 
 
 		 532 aa  276  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  35.06 
 
 		 521 aa  270  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  37 
 
 		 621 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  35.37 
 
 		 568 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  34.64 
 
 		 1219 aa  259  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  36.61 
 
 		 657 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  36.9 
 
 		 535 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  36.26 
 
 		 918 aa  251  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  35.78 
 
 		 580 aa  239  9e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  32.42 
 
 		 899 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  34.52 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  34.04 
 
 		 1219 aa  226  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  32.84 
 
 		 552 aa  220  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  34.17 
 
 		 570 aa  219  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  32.91 
 
 		 560 aa  208  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  34.57 
 
 		 1184 aa  207  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  38.08 
 
 		 1184 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  38.08 
 
 		 1168 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  38.08 
 
 		 1263 aa  203  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  29.57 
 
 		 552 aa  202  9e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  35.1 
 
 		 1224 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  35.31 
 
 		 1209 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  32.98 
 
 		 715 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  28.65 
 
 		 565 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  30.36 
 
 		 708 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  30.09 
 
 		 665 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  29.22 
 
 		 598 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  31.26 
 
 		 1652 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  30.04 
 
 		 575 aa  154  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.24 
 
 		 579 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  27.86 
 
 		 523 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  27.46 
 
 		 569 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  26.91 
 
 		 614 aa  137  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  28.21 
 
 		 700 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  26.78 
 
 		 521 aa  134  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  24.95 
 
 		 563 aa  129  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  25.56 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  27.97 
 
 		 519 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 		 526 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  27.18 
 
 		 529 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  28.26 
 
 		 522 aa  117  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  30.68 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  25.69 
 
 		 522 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  26.81 
 
 		 539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  26.13 
 
 		 544 aa  113  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  26.19 
 
 		 521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  26.81 
 
 		 521 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  26.8 
 
 		 528 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  27.99 
 
 		 520 aa  108  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2529  integral membrane protein MviN  24.82 
 
 		 537 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  26.78 
 
 		 521 aa  107  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  25 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  25 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  25 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  25 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  24.68 
 
 		 522 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  25 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  23.25 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 		 535 aa  104  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  27.84 
 
 		 526 aa  104  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  27.53 
 
 		 524 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  24.82 
 
 		 511 aa  103  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  24.62 
 
 		 511 aa  103  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  25.47 
 
 		 529 aa  101  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  27.84 
 
 		 545 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  22.45 
 
 		 514 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  25.26 
 
 		 534 aa  100  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  25.14 
 
 		 512 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  24.69 
 
 		 511 aa  100  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  26.69 
 
 		 521 aa  99.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  25.14 
 
 		 512 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3143  virulence factor MVIN family protein  29.15 
 
 		 532 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0110938  normal  0.770926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  28.66 
 
 		 541 aa  99.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  23.26 
 
 		 511 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  26.57 
 
 		 613 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  24.46 
 
 		 511 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  24.46 
 
 		 511 aa  99  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  24.46 
 
 		 511 aa  99.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  26.68 
 
 		 521 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  24.46 
 
 		 511 aa  99  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  24.46 
 
 		 511 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  24.46 
 
 		 511 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  24.46 
 
 		 511 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  24.46 
 
 		 511 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  24.46 
 
 		 511 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  29.14 
 
 		 648 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  25.46 
 
 		 512 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  25.28 
 
 		 511 aa  98.2  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  22.43 
 
 		 521 aa  97.1  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>