More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4843 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  41.66 
 
 		 1209 aa  731    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  100 
 
 		 1219 aa  2390    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  41.38 
 
 		 1184 aa  711    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  46.87 
 
 		 1219 aa  995    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  41.3 
 
 		 1263 aa  716    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  41.8 
 
 		 1168 aa  702    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  41.42 
 
 		 1184 aa  711    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  42.82 
 
 		 1224 aa  760    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  32.24 
 
 		 1217 aa  406  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  40.69 
 
 		 610 aa  367  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  41.18 
 
 		 521 aa  356  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  48.42 
 
 		 674 aa  337  7.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  35.35 
 
 		 918 aa  253  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  36.93 
 
 		 657 aa  251  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  34.64 
 
 		 546 aa  235  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  32.1 
 
 		 534 aa  218  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  32.42 
 
 		 621 aa  214  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  34.41 
 
 		 559 aa  209  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  30.22 
 
 		 899 aa  209  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  37.35 
 
 		 535 aa  207  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  33.03 
 
 		 580 aa  202  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  32.99 
 
 		 532 aa  201  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  32.98 
 
 		 592 aa  197  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  33.19 
 
 		 627 aa  195  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  34.52 
 
 		 533 aa  193  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  33.63 
 
 		 526 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  34.41 
 
 		 568 aa  191  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39640  hypothetical protein  31.96 
 
 		 509 aa  184  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7083  hypothetical protein  32.83 
 
 		 502 aa  184  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0037  hypothetical protein  32.96 
 
 		 623 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0046  hypothetical protein  32.96 
 
 		 623 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  35.82 
 
 		 570 aa  179  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  32.7 
 
 		 580 aa  179  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0027  hypothetical protein  32.77 
 
 		 623 aa  175  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.476694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  33.63 
 
 		 665 aa  169  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  32.38 
 
 		 560 aa  167  8e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  30.58 
 
 		 552 aa  165  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  29 
 
 		 1652 aa  156  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  30.2 
 
 		 614 aa  153  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  29.13 
 
 		 715 aa  151  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  29.61 
 
 		 708 aa  147  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.73 
 
 		 579 aa  136  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  25.23 
 
 		 700 aa  134  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  31.54 
 
 		 552 aa  132  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  28.75 
 
 		 565 aa  129  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  28.17 
 
 		 575 aa  126  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  27.35 
 
 		 522 aa  122  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.12 
 
 		 563 aa  117  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  27.49 
 
 		 598 aa  117  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  28.95 
 
 		 539 aa  116  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  25.88 
 
 		 511 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  30.44 
 
 		 569 aa  115  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  30.11 
 
 		 535 aa  114  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  26.19 
 
 		 521 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  26.64 
 
 		 523 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  27.13 
 
 		 511 aa  112  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5083  hypothetical protein  28.57 
 
 		 544 aa  110  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474082  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  28.82 
 
 		 528 aa  110  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  27.32 
 
 		 535 aa  106  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  27.13 
 
 		 534 aa  107  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  26.89 
 
 		 523 aa  106  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  31.12 
 
 		 543 aa  106  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  30.69 
 
 		 517 aa  106  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  25.21 
 
 		 511 aa  106  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  25.45 
 
 		 524 aa  105  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  25.45 
 
 		 524 aa  105  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  27.89 
 
 		 544 aa  105  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  25.45 
 
 		 524 aa  105  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  25.45 
 
 		 524 aa  105  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  25.45 
 
 		 524 aa  105  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  26.16 
 
 		 526 aa  104  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  27.45 
 
 		 521 aa  105  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  30.37 
 
 		 529 aa  104  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  25.36 
 
 		 511 aa  103  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  24.44 
 
 		 511 aa  102  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  27.76 
 
 		 505 aa  100  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  28.91 
 
 		 573 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  27.27 
 
 		 511 aa  101  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  25.23 
 
 		 511 aa  100  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  28.67 
 
 		 516 aa  100  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  26.07 
 
 		 521 aa  100  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  26.99 
 
 		 521 aa  100  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  28.08 
 
 		 521 aa  100  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  27.59 
 
 		 511 aa  99  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  27.59 
 
 		 511 aa  99  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  27.59 
 
 		 511 aa  99  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  27.59 
 
 		 511 aa  99  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  27.37 
 
 		 511 aa  99  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  27.37 
 
 		 511 aa  99  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  27.37 
 
 		 511 aa  99  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  27.37 
 
 		 511 aa  99  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  27.37 
 
 		 511 aa  99  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  30.03 
 
 		 534 aa  98.6  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  26.3 
 
 		 518 aa  97.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  28.28 
 
 		 520 aa  97.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2529  integral membrane protein MviN  24.74 
 
 		 537 aa  96.3  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1590  integral membrane protein MviN  27.34 
 
 		 521 aa  96.7  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.814029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  27.35 
 
 		 522 aa  96.3  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  27.2 
 
 		 518 aa  96.3  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  27.68 
 
 		 521 aa  95.5  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>