More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3104 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  64.92 
 
 		 568 aa  646    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  100 
 
 		 627 aa  1236    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  47.49 
 
 		 621 aa  501  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  48.42 
 
 		 534 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  44.65 
 
 		 532 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  43.29 
 
 		 526 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  44.46 
 
 		 559 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  39.42 
 
 		 657 aa  330  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  46.59 
 
 		 674 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  38.83 
 
 		 918 aa  311  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  37.93 
 
 		 1217 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  39.62 
 
 		 535 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  35.29 
 
 		 580 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  36.77 
 
 		 592 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  33.57 
 
 		 899 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  35.44 
 
 		 533 aa  264  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  35.75 
 
 		 546 aa  262  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  37.91 
 
 		 580 aa  261  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  36.18 
 
 		 610 aa  261  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  35.3 
 
 		 521 aa  249  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  34.04 
 
 		 552 aa  246  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  35.24 
 
 		 665 aa  239  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  38.29 
 
 		 570 aa  237  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  37.6 
 
 		 565 aa  227  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  33.19 
 
 		 1219 aa  205  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  33.39 
 
 		 715 aa  203  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  31.64 
 
 		 552 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  35.95 
 
 		 1652 aa  195  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  34.13 
 
 		 708 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  33.97 
 
 		 1168 aa  193  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  33.97 
 
 		 1184 aa  193  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  33.97 
 
 		 1263 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  31.49 
 
 		 1184 aa  192  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  32.74 
 
 		 560 aa  191  4e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  33.66 
 
 		 1224 aa  191  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  33.97 
 
 		 1209 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  29.98 
 
 		 1219 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  29.07 
 
 		 614 aa  174  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  30.88 
 
 		 575 aa  170  8e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  30.55 
 
 		 569 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  33.53 
 
 		 517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  28.1 
 
 		 521 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  27.44 
 
 		 521 aa  152  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  27.87 
 
 		 700 aa  147  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  33 
 
 		 535 aa  147  6e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.5 
 
 		 535 aa  146  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  28.57 
 
 		 598 aa  145  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  33.87 
 
 		 579 aa  144  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  31.33 
 
 		 526 aa  140  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.16 
 
 		 563 aa  139  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  26.74 
 
 		 522 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  27.12 
 
 		 523 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  28.63 
 
 		 613 aa  134  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  25.64 
 
 		 522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  29.19 
 
 		 535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  28.76 
 
 		 535 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 		 535 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  22.88 
 
 		 512 aa  126  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 		 517 aa  124  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 		 517 aa  124  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  28.75 
 
 		 541 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  27.09 
 
 		 529 aa  124  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  27.61 
 
 		 521 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1296  integral membrane protein MviN  26.6 
 
 		 538 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  27.8 
 
 		 534 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  23.76 
 
 		 525 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  27.76 
 
 		 526 aa  120  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  26.37 
 
 		 530 aa  120  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  25.23 
 
 		 501 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  26.74 
 
 		 555 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  28.33 
 
 		 521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  27.64 
 
 		 524 aa  118  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  26.81 
 
 		 529 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  23.96 
 
 		 544 aa  117  7.999999999999999e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1590  integral membrane protein MviN  27.12 
 
 		 521 aa  117  7.999999999999999e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.814029  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  27.34 
 
 		 517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  26.89 
 
 		 521 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  26.55 
 
 		 516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  26.89 
 
 		 545 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  25.31 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  27.36 
 
 		 516 aa  115  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  29.8 
 
 		 525 aa  114  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  27.36 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  29.21 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  22.59 
 
 		 494 aa  114  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  27.51 
 
 		 532 aa  114  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  26.58 
 
 		 648 aa  113  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  26.54 
 
 		 524 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  26.54 
 
 		 524 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0249  integral membrane protein MviN  28.96 
 
 		 535 aa  113  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  27.7 
 
 		 521 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0707  integral membrane protein MviN  26.75 
 
 		 514 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  27.75 
 
 		 534 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  26.54 
 
 		 529 aa  113  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  26.54 
 
 		 524 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  26.54 
 
 		 524 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0736  virulence factor MVIN family protein  26.76 
 
 		 537 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  26.54 
 
 		 524 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2444  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 		 548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410377  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  29.75 
 
 		 556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>