More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09620 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  100 
 
 
535 aa  1071    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  34.89 
 
 
563 aa  322  8e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  39.66 
 
 
700 aa  302  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  33.02 
 
 
544 aa  281  2e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  38.14 
 
 
517 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  29.12 
 
 
657 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  29.02 
 
 
621 aa  156  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  28.39 
 
 
521 aa  151  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  27.37 
 
 
534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  28.33 
 
 
539 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  25.84 
 
 
1217 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  28.98 
 
 
526 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  30.18 
 
 
535 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  29.56 
 
 
918 aa  140  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  28.9 
 
 
627 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  28.42 
 
 
674 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  26.75 
 
 
610 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 
535 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  27.32 
 
 
568 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  27.98 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  29.55 
 
 
552 aa  134  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  31.81 
 
 
521 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  29.35 
 
 
552 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  26.98 
 
 
559 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2444  integral membrane protein MviN  32.79 
 
 
548 aa  127  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410377  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  28.76 
 
 
560 aa  126  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  26.99 
 
 
522 aa  124  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  32.47 
 
 
533 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  26.49 
 
 
521 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  27.22 
 
 
580 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  27.66 
 
 
899 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  28.03 
 
 
592 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  26.26 
 
 
526 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  24.65 
 
 
521 aa  113  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  25.74 
 
 
1219 aa  113  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  27.03 
 
 
514 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  26.36 
 
 
512 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  27.84 
 
 
521 aa  111  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  26.91 
 
 
521 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  27.22 
 
 
512 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  25.8 
 
 
495 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2027  hypothetical protein  32.67 
 
 
539 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  28 
 
 
522 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  25.52 
 
 
524 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  27.14 
 
 
522 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  26.07 
 
 
517 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  27.95 
 
 
528 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  29.74 
 
 
541 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  25.79 
 
 
511 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  23.96 
 
 
534 aa  107  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  27.5 
 
 
530 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0840  integral membrane protein MviN  22.45 
 
 
506 aa  107  6e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.115709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6052  membrane protein putative virulence factor-like protein  26.67 
 
 
549 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612093  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  26.54 
 
 
534 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  27.98 
 
 
535 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  27.22 
 
 
530 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  25.43 
 
 
511 aa  105  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  32.92 
 
 
538 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  27.87 
 
 
529 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  26.39 
 
 
512 aa  103  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  26.36 
 
 
512 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  27 
 
 
517 aa  103  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  27.75 
 
 
715 aa  103  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  26.36 
 
 
512 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  25.2 
 
 
494 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  28.88 
 
 
570 aa  103  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  27.74 
 
 
535 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  24.36 
 
 
511 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  27.87 
 
 
523 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  24.14 
 
 
525 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  24.86 
 
 
524 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  24.86 
 
 
524 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  24.86 
 
 
524 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  27.74 
 
 
535 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  24.86 
 
 
524 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  24.86 
 
 
524 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  24.07 
 
 
511 aa  101  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  25.61 
 
 
546 aa  100  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  26.69 
 
 
521 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  24.64 
 
 
511 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  24.69 
 
 
613 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 
526 aa  99  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2175  virulence factor MVIN family protein  29.75 
 
 
527 aa  98.2  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134074  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  24.83 
 
 
528 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  27.96 
 
 
526 aa  98.2  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  28.12 
 
 
529 aa  97.4  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  24.93 
 
 
511 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  24.93 
 
 
511 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  24.93 
 
 
511 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  24.93 
 
 
511 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  24.93 
 
 
511 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  25.07 
 
 
512 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  24.93 
 
 
511 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  23.5 
 
 
511 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  27.01 
 
 
555 aa  96.3  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  24.93 
 
 
511 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  24.93 
 
 
511 aa  96.3  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  24.93 
 
 
511 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  25.32 
 
 
1219 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  23.78 
 
 
511 aa  95.9  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>