More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_9038 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 899 aa  1792    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  45.37 
 
 		 665 aa  376  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  33.04 
 
 		 918 aa  335  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  41.32 
 
 		 559 aa  323  9.999999999999999e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  37.64 
 
 		 657 aa  295  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  38.6 
 
 		 621 aa  294  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  38.03 
 
 		 534 aa  292  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  40.94 
 
 		 674 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  36.59 
 
 		 526 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  37.55 
 
 		 532 aa  283  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  35.63 
 
 		 552 aa  278  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  37.99 
 
 		 535 aa  269  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  33.16 
 
 		 627 aa  268  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  36.5 
 
 		 568 aa  263  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  33.27 
 
 		 580 aa  247  9e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  38.35 
 
 		 560 aa  246  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  35.8 
 
 		 570 aa  246  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  33.27 
 
 		 715 aa  244  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  34.13 
 
 		 533 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  33.94 
 
 		 1652 aa  243  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  32.78 
 
 		 592 aa  242  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  32.8 
 
 		 1217 aa  241  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  34.77 
 
 		 552 aa  239  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 565 aa  238  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  33.76 
 
 		 580 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  34.05 
 
 		 708 aa  232  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  33.89 
 
 		 610 aa  230  9e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  34.69 
 
 		 569 aa  218  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  31.66 
 
 		 1219 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  32.06 
 
 		 546 aa  207  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  30.64 
 
 		 1219 aa  207  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  34.32 
 
 		 598 aa  206  2e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  35.13 
 
 		 614 aa  206  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  34.53 
 
 		 521 aa  205  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  31.06 
 
 		 1209 aa  195  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  31.9 
 
 		 1224 aa  194  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  34.32 
 
 		 575 aa  193  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  30.04 
 
 		 1184 aa  192  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 1263 aa  187  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 1184 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 1168 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  32.11 
 
 		 579 aa  165  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  31.3 
 
 		 535 aa  150  9e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  29.29 
 
 		 517 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 		 529 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  26.01 
 
 		 521 aa  121  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  30.75 
 
 		 543 aa  120  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  26.02 
 
 		 539 aa  120  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  24.39 
 
 		 700 aa  120  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  26.95 
 
 		 521 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.53 
 
 		 563 aa  117  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.31 
 
 		 535 aa  115  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  29.17 
 
 		 521 aa  114  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 		 514 aa  110  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  26.49 
 
 		 529 aa  109  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  25.64 
 
 		 522 aa  108  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  26.26 
 
 		 549 aa  108  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  25.23 
 
 		 526 aa  108  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  25.55 
 
 		 523 aa  107  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2529  integral membrane protein MviN  24.84 
 
 		 537 aa  106  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 		 513 aa  106  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  27.29 
 
 		 521 aa  105  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  28.33 
 
 		 513 aa  104  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  24.23 
 
 		 521 aa  104  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  27.07 
 
 		 511 aa  104  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  26.19 
 
 		 555 aa  104  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  29.98 
 
 		 534 aa  103  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  30.24 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  28.74 
 
 		 545 aa  102  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  27.36 
 
 		 528 aa  102  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  27.81 
 
 		 526 aa  102  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  26.73 
 
 		 613 aa  100  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  23.47 
 
 		 544 aa  100  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  28.74 
 
 		 573 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  26.86 
 
 		 529 aa  100  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  27.81 
 
 		 528 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  27.18 
 
 		 505 aa  100  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  23.08 
 
 		 534 aa  100  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  28.09 
 
 		 518 aa  99.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  25.94 
 
 		 533 aa  99.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  27.56 
 
 		 524 aa  99.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  26.38 
 
 		 516 aa  99.4  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 		 530 aa  99  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  27.3 
 
 		 522 aa  99.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  26.56 
 
 		 521 aa  97.4  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  28.1 
 
 		 532 aa  97.4  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  30.41 
 
 		 522 aa  97.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  28.86 
 
 		 513 aa  97.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  27.63 
 
 		 535 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  28.07 
 
 		 521 aa  96.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  26.76 
 
 		 511 aa  96.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  26.84 
 
 		 526 aa  96.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  25.41 
 
 		 522 aa  95.5  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  27.63 
 
 		 535 aa  95.5  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  27.32 
 
 		 522 aa  95.1  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  27.78 
 
 		 518 aa  95.1  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  28.06 
 
 		 517 aa  94.7  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  26.57 
 
 		 534 aa  95.1  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  26.07 
 
 		 523 aa  95.1  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  26.73 
 
 		 519 aa  95.1  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>