More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0939 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  100 
 
 		 544 aa  1097    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  42.91 
 
 		 563 aa  456  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  42.54 
 
 		 700 aa  415  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  33.4 
 
 		 535 aa  288  2e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  33.04 
 
 		 517 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  27.09 
 
 		 657 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  29.11 
 
 		 535 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  29.88 
 
 		 610 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  28.61 
 
 		 674 aa  137  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  26.73 
 
 		 1217 aa  133  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  24.04 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  25.76 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  25.38 
 
 		 521 aa  127  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 		 580 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  26.19 
 
 		 621 aa  124  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  27.47 
 
 		 528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  24.79 
 
 		 534 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  25.05 
 
 		 534 aa  120  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  25.57 
 
 		 1219 aa  119  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  27.84 
 
 		 533 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  23.31 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  27.25 
 
 		 918 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  25.1 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  23.26 
 
 		 521 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  27.97 
 
 		 494 aa  113  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  26.63 
 
 		 648 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  25.46 
 
 		 516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  26.1 
 
 		 511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  23.96 
 
 		 627 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  26.91 
 
 		 511 aa  110  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  26.91 
 
 		 511 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  26.91 
 
 		 511 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  26.91 
 
 		 511 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  24.73 
 
 		 534 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  26.91 
 
 		 511 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  26.91 
 
 		 511 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  26.91 
 
 		 511 aa  110  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  26.91 
 
 		 511 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  26.91 
 
 		 511 aa  110  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0707  integral membrane protein MviN  23.44 
 
 		 514 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  26.37 
 
 		 524 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  26.37 
 
 		 524 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  26.37 
 
 		 524 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  26.37 
 
 		 524 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  26.37 
 
 		 524 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  27.07 
 
 		 521 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  25.46 
 
 		 523 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  25.73 
 
 		 523 aa  110  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  27.18 
 
 		 513 aa  109  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  25.74 
 
 		 559 aa  109  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  25.49 
 
 		 545 aa  108  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  27.22 
 
 		 552 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  24.31 
 
 		 539 aa  107  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  27.15 
 
 		 512 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  23.56 
 
 		 532 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  27.15 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  25.82 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  28.16 
 
 		 1219 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  25.68 
 
 		 512 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  25 
 
 		 530 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  25 
 
 		 530 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  26.89 
 
 		 517 aa  103  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1130  virulence factor MVIN family protein  29.74 
 
 		 538 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  25.89 
 
 		 517 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  27.1 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  26.43 
 
 		 570 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0885  integral membrane protein MviN  24.89 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000255547  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  23.08 
 
 		 514 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  24.06 
 
 		 522 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  22 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  24.57 
 
 		 521 aa  102  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  26.61 
 
 		 501 aa  101  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  23.55 
 
 		 522 aa  101  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  26.62 
 
 		 535 aa  101  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  26.36 
 
 		 511 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  26.61 
 
 		 526 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  23.78 
 
 		 526 aa  98.6  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  23.09 
 
 		 535 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  24.47 
 
 		 542 aa  98.2  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  26.49 
 
 		 513 aa  98.2  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  24.38 
 
 		 511 aa  97.8  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  23.99 
 
 		 575 aa  97.8  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  23.72 
 
 		 899 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  24.73 
 
 		 511 aa  97.4  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  25.13 
 
 		 511 aa  97.1  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  26.57 
 
 		 521 aa  97.1  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.13 
 
 		 964 aa  97.1  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  25.62 
 
 		 522 aa  97.1  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  26.63 
 
 		 573 aa  96.7  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  28.25 
 
 		 519 aa  96.7  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  25.33 
 
 		 552 aa  96.3  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  24.66 
 
 		 511 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  28.46 
 
 		 511 aa  96.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  24.38 
 
 		 521 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  25.9 
 
 		 546 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  22.66 
 
 		 535 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  23.91 
 
 		 511 aa  95.1  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  26.05 
 
 		 521 aa  94.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  22.88 
 
 		 535 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  25.46 
 
 		 538 aa  95.1  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>