275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0056 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  100 
 
 		 598 aa  1210    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  54.51 
 
 		 575 aa  593  1e-168  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  36.04 
 
 		 552 aa  354  2.9999999999999997e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  33.46 
 
 		 580 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  32.08 
 
 		 565 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  32.32 
 
 		 569 aa  302  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  34.57 
 
 		 570 aa  291  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  35.56 
 
 		 560 aa  251  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  33.82 
 
 		 1652 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  30.45 
 
 		 715 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  29.86 
 
 		 614 aa  219  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  32.5 
 
 		 899 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  33.99 
 
 		 708 aa  218  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  31.32 
 
 		 532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  28.88 
 
 		 552 aa  182  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  28.89 
 
 		 621 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  29.98 
 
 		 568 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  30.55 
 
 		 534 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  30.62 
 
 		 674 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  29.59 
 
 		 665 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  28.89 
 
 		 559 aa  167  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  29.77 
 
 		 610 aa  166  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 		 580 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  26.74 
 
 		 1217 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  28.29 
 
 		 546 aa  163  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  30.79 
 
 		 526 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  29.24 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.83 
 
 		 579 aa  156  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  26.67 
 
 		 592 aa  148  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  27.8 
 
 		 627 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  26.55 
 
 		 657 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  27.2 
 
 		 521 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  29.1 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  26.06 
 
 		 918 aa  134  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  27.49 
 
 		 535 aa  121  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  27.7 
 
 		 1219 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  27.8 
 
 		 1219 aa  117  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  28.14 
 
 		 1224 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  29 
 
 		 1184 aa  106  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  30.12 
 
 		 1209 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  27.2 
 
 		 1168 aa  104  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  27.2 
 
 		 1184 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  27.2 
 
 		 1263 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  24.75 
 
 		 539 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  23.76 
 
 		 549 aa  97.4  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  26.05 
 
 		 535 aa  96.7  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  28.45 
 
 		 517 aa  94.4  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  25.58 
 
 		 700 aa  89.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  24.45 
 
 		 534 aa  87.4  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  25.97 
 
 		 541 aa  87  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  26.12 
 
 		 521 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  24.7 
 
 		 521 aa  81.6  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  23.47 
 
 		 563 aa  80.5  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  26.67 
 
 		 613 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  22.76 
 
 		 544 aa  77.8  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2971  integral membrane protein MviN  26.02 
 
 		 525 aa  77  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000053192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  24.89 
 
 		 529 aa  77  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  25.9 
 
 		 529 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  23.67 
 
 		 514 aa  75.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  22.95 
 
 		 518 aa  75.1  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  25.34 
 
 		 517 aa  74.3  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  25.46 
 
 		 525 aa  74.3  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  24.29 
 
 		 521 aa  74.3  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  24.84 
 
 		 529 aa  73.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  26.1 
 
 		 523 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0865  virulence factor MVIN family protein  25.25 
 
 		 444 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  26.49 
 
 		 526 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  22.59 
 
 		 538 aa  72.8  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3077  integral membrane protein MviN  25.53 
 
 		 543 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000112933  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  27.68 
 
 		 520 aa  72.4  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  24.63 
 
 		 555 aa  72  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  24.45 
 
 		 515 aa  72  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6052  membrane protein putative virulence factor-like protein  22.89 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  25.12 
 
 		 543 aa  70.5  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  24.58 
 
 		 528 aa  70.5  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1590  integral membrane protein MviN  24.11 
 
 		 521 aa  69.7  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.814029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3143  virulence factor MVIN family protein  25.55 
 
 		 532 aa  69.3  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0110938  normal  0.770926 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2529  integral membrane protein MviN  24.94 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  25.33 
 
 		 964 aa  68.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2175  virulence factor MVIN family protein  23.58 
 
 		 527 aa  67.8  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134074  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  22.51 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  23.64 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  22.51 
 
 		 513 aa  67.4  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0370  integral membrane protein MviN  25.05 
 
 		 519 aa  67  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.501558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  24.44 
 
 		 508 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  25.3 
 
 		 514 aa  66.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  22.32 
 
 		 648 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  23.84 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  24.32 
 
 		 513 aa  66.2  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  23.02 
 
 		 519 aa  65.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  22.93 
 
 		 522 aa  65.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  23.74 
 
 		 531 aa  65.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  24.15 
 
 		 522 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  23.24 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  22.75 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  24.15 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1917  virulence factor MVIN family protein  26.93 
 
 		 568 aa  64.7  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.731846  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1346  virulence factor MVIN family protein  25 
 
 		 557 aa  64.3  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.817252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  24.3 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2007  virulence factor MVIN family protein  24.4 
 
 		 552 aa  64.3  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.4064  normal  0.087601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>