More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3574 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  64.49 
 
 		 534 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 532 aa  1038    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  44.83 
 
 		 627 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  43.53 
 
 		 568 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  44.83 
 
 		 526 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  44.78 
 
 		 621 aa  398  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  42.75 
 
 		 559 aa  351  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  42.19 
 
 		 918 aa  333  6e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  46.04 
 
 		 657 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  37.55 
 
 		 899 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  45.96 
 
 		 674 aa  307  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  38.72 
 
 		 1217 aa  291  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  37.67 
 
 		 533 aa  289  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  34.3 
 
 		 552 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  37.62 
 
 		 535 aa  276  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  37.97 
 
 		 592 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  37.85 
 
 		 580 aa  266  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  36.8 
 
 		 546 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  38.53 
 
 		 570 aa  263  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  35.08 
 
 		 610 aa  259  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  34.21 
 
 		 521 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  37.87 
 
 		 665 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  34.4 
 
 		 580 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  31.11 
 
 		 1219 aa  226  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  35.36 
 
 		 560 aa  225  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  35.99 
 
 		 565 aa  223  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  33.19 
 
 		 1184 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  33.49 
 
 		 552 aa  213  7.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  35.65 
 
 		 1209 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  33.77 
 
 		 1219 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  34.75 
 
 		 1224 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  32.1 
 
 		 1168 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  32.1 
 
 		 1184 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  32.1 
 
 		 1263 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  32.02 
 
 		 575 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  32.38 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  32.5 
 
 		 715 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  32.85 
 
 		 708 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  31.32 
 
 		 598 aa  187  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  35.76 
 
 		 535 aa  180  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  29.03 
 
 		 539 aa  173  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  33.64 
 
 		 1652 aa  172  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  28.93 
 
 		 529 aa  169  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  32.09 
 
 		 579 aa  169  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  29.07 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  30.81 
 
 		 614 aa  169  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  28.93 
 
 		 555 aa  161  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 517 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  28.42 
 
 		 529 aa  159  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  27.98 
 
 		 535 aa  147  5e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.72 
 
 		 563 aa  147  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  27.37 
 
 		 494 aa  146  9e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  27.64 
 
 		 521 aa  144  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  30.71 
 
 		 526 aa  144  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  30.16 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  24.95 
 
 		 525 aa  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  26.45 
 
 		 522 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  27.44 
 
 		 522 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  28.17 
 
 		 522 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  27.24 
 
 		 529 aa  137  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  25.5 
 
 		 700 aa  136  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  29.31 
 
 		 521 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  25.65 
 
 		 511 aa  135  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  28.23 
 
 		 521 aa  135  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  27.52 
 
 		 512 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  26.49 
 
 		 514 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  25.49 
 
 		 511 aa  133  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  26.05 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  26.05 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  26.75 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  26.05 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  27.18 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  26.05 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  25.83 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  25.83 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  25.83 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  25.83 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  25.83 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  27.59 
 
 		 526 aa  131  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  26.06 
 
 		 524 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  26.06 
 
 		 524 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  26.81 
 
 		 512 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  26.06 
 
 		 524 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  26.06 
 
 		 524 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  28.16 
 
 		 530 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  26.06 
 
 		 524 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  28.09 
 
 		 522 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  28.92 
 
 		 613 aa  130  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  28.82 
 
 		 521 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  26.83 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  26.83 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  26.86 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  28.67 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  25.48 
 
 		 549 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  25.15 
 
 		 511 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  27.45 
 
 		 535 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  26.68 
 
 		 516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  27.06 
 
 		 541 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 		 524 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  25.1 
 
 		 511 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>