More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5082 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 674 aa  1248    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  46.33 
 
 		 1217 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  46.37 
 
 		 610 aa  382  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  45.3 
 
 		 521 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  47.14 
 
 		 1219 aa  363  7.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  41.73 
 
 		 534 aa  334  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  41.87 
 
 		 568 aa  323  5e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  44.28 
 
 		 627 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  42.14 
 
 		 918 aa  320  6e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  42.8 
 
 		 621 aa  319  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  42.02 
 
 		 1219 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  42.97 
 
 		 657 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  41.48 
 
 		 1224 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  41.92 
 
 		 1184 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  41.73 
 
 		 1168 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  40.11 
 
 		 526 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  37.06 
 
 		 899 aa  305  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  39.64 
 
 		 1209 aa  304  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  41.46 
 
 		 1184 aa  302  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  41.53 
 
 		 559 aa  299  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  39.72 
 
 		 1263 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  42 
 
 		 532 aa  294  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  41.36 
 
 		 546 aa  293  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  41.21 
 
 		 580 aa  280  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  39.78 
 
 		 592 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  44.36 
 
 		 535 aa  267  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  42.78 
 
 		 533 aa  259  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  39 
 
 		 580 aa  243  7.999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  36.69 
 
 		 560 aa  240  6.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  37.25 
 
 		 552 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  38.61 
 
 		 665 aa  233  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  37.4 
 
 		 570 aa  230  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  35.53 
 
 		 1652 aa  210  9e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  32.64 
 
 		 708 aa  199  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  32.26 
 
 		 715 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  33.98 
 
 		 565 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  31.88 
 
 		 579 aa  179  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  32.88 
 
 		 614 aa  173  7.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  34.35 
 
 		 569 aa  172  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  37.5 
 
 		 517 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  30.62 
 
 		 598 aa  170  6e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  31.5 
 
 		 552 aa  169  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  26.15 
 
 		 700 aa  160  9e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.93 
 
 		 563 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  30.07 
 
 		 521 aa  157  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  31 
 
 		 575 aa  152  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  34.8 
 
 		 535 aa  151  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  29.85 
 
 		 526 aa  147  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  30.38 
 
 		 519 aa  145  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  30.96 
 
 		 529 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  29.32 
 
 		 521 aa  144  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  29.34 
 
 		 522 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  31.99 
 
 		 521 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  26.76 
 
 		 535 aa  139  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  27.82 
 
 		 519 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  27.82 
 
 		 519 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  31.25 
 
 		 512 aa  137  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  26.56 
 
 		 505 aa  136  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  27.68 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  27.68 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  29.98 
 
 		 534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  27.75 
 
 		 544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  27.68 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  27.68 
 
 		 519 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  27.86 
 
 		 519 aa  135  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  28.78 
 
 		 521 aa  135  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  29.19 
 
 		 519 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  31.78 
 
 		 526 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  28.12 
 
 		 519 aa  135  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  27.7 
 
 		 523 aa  134  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  28.26 
 
 		 518 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  30.31 
 
 		 528 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  31.32 
 
 		 521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  28.16 
 
 		 539 aa  130  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  30.02 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  27.47 
 
 		 520 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  28.81 
 
 		 521 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  27.82 
 
 		 519 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  27.13 
 
 		 531 aa  129  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  30.68 
 
 		 530 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  28.37 
 
 		 519 aa  128  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  29.27 
 
 		 522 aa  129  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  30.5 
 
 		 512 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  30.09 
 
 		 534 aa  127  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  27.93 
 
 		 511 aa  127  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  30.5 
 
 		 512 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  30.87 
 
 		 517 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  30.65 
 
 		 512 aa  126  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  29.76 
 
 		 522 aa  126  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  27.75 
 
 		 521 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  30.56 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  30.09 
 
 		 523 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  32.1 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  26.38 
 
 		 519 aa  126  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  30.25 
 
 		 512 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  27.38 
 
 		 519 aa  125  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2444  integral membrane protein MviN  31.81 
 
 		 548 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410377  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  28.05 
 
 		 516 aa  124  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  27.4 
 
 		 534 aa  124  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  29.43 
 
 		 521 aa  124  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>