More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4852 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 568 aa  1105    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  62.96 
 
 		 627 aa  659    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  52.21 
 
 		 621 aa  522  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  45.07 
 
 		 534 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  43.46 
 
 		 532 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  41.67 
 
 		 526 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  42.68 
 
 		 559 aa  348  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  46.21 
 
 		 674 aa  323  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  38.16 
 
 		 657 aa  310  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  38.02 
 
 		 918 aa  295  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  38.81 
 
 		 1217 aa  286  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  38.85 
 
 		 535 aa  276  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  36.35 
 
 		 899 aa  270  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  35.88 
 
 		 580 aa  269  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  34.79 
 
 		 592 aa  264  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  36.13 
 
 		 610 aa  263  8e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  34.16 
 
 		 546 aa  254  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  35.97 
 
 		 580 aa  246  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  32.34 
 
 		 521 aa  243  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 533 aa  236  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  37.11 
 
 		 570 aa  236  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  38.49 
 
 		 665 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  32.84 
 
 		 552 aa  225  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  34.18 
 
 		 1219 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  32.86 
 
 		 552 aa  218  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  33.09 
 
 		 715 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  33.26 
 
 		 560 aa  204  5e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  34.89 
 
 		 565 aa  201  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  31.05 
 
 		 1219 aa  197  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  31.61 
 
 		 708 aa  190  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  29.59 
 
 		 614 aa  179  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  34.75 
 
 		 1652 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  33.06 
 
 		 1224 aa  176  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  31.45 
 
 		 1184 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  33.68 
 
 		 1209 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  31.22 
 
 		 598 aa  173  6.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  33.18 
 
 		 569 aa  171  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  30.26 
 
 		 1168 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  30.28 
 
 		 1184 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  30.28 
 
 		 1263 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  29.38 
 
 		 575 aa  155  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  27.87 
 
 		 535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  31.44 
 
 		 517 aa  146  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  33 
 
 		 579 aa  144  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  29.84 
 
 		 529 aa  141  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  30.12 
 
 		 529 aa  140  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  26.24 
 
 		 521 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  31.06 
 
 		 535 aa  135  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  29.5 
 
 		 555 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  28.09 
 
 		 573 aa  130  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  29.33 
 
 		 535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  25.21 
 
 		 521 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  26.63 
 
 		 700 aa  129  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  27.42 
 
 		 526 aa  128  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  27.82 
 
 		 563 aa  126  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  28.61 
 
 		 521 aa  124  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  27.96 
 
 		 541 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  27.21 
 
 		 529 aa  123  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  27.07 
 
 		 532 aa  121  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  27.07 
 
 		 521 aa  121  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  28.67 
 
 		 517 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  26.98 
 
 		 514 aa  120  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  28.74 
 
 		 512 aa  120  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  28.43 
 
 		 543 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  31.48 
 
 		 515 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  26.84 
 
 		 528 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  24.45 
 
 		 539 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  25.81 
 
 		 530 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  27.62 
 
 		 521 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  27.91 
 
 		 535 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  26.28 
 
 		 530 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  25.37 
 
 		 521 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  25.35 
 
 		 530 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  27.1 
 
 		 613 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  28.47 
 
 		 512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 		 513 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  27.67 
 
 		 535 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 		 516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 		 513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  28.27 
 
 		 521 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  28.22 
 
 		 513 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  28.61 
 
 		 512 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  27.68 
 
 		 512 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  27.93 
 
 		 526 aa  115  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  25.98 
 
 		 521 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  27.44 
 
 		 519 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  26.44 
 
 		 512 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  26.05 
 
 		 522 aa  114  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  28.08 
 
 		 535 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  24.54 
 
 		 525 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  26.44 
 
 		 512 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  27.51 
 
 		 514 aa  113  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  26.44 
 
 		 512 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  27.01 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  26.84 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  24.77 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  25.71 
 
 		 511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  27.4 
 
 		 534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  26.59 
 
 		 521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  27.21 
 
 		 534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>