268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3365 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  100 
 
 
569 aa  1112    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  45.1 
 
 
552 aa  444  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  46.34 
 
 
565 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  41.84 
 
 
580 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  35.2 
 
 
575 aa  316  9e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  41.33 
 
 
1652 aa  300  6e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  32.15 
 
 
598 aa  292  9e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  40.3 
 
 
570 aa  290  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  35.85 
 
 
715 aa  270  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  37.35 
 
 
708 aa  264  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  35.82 
 
 
614 aa  251  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  38.11 
 
 
560 aa  240  5.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  34.04 
 
 
899 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  32.09 
 
 
552 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  35.49 
 
 
559 aa  211  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  32.18 
 
 
532 aa  189  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  34.26 
 
 
1217 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  32.09 
 
 
657 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  31.34 
 
 
534 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  31.98 
 
 
918 aa  180  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  34.35 
 
 
674 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  30.92 
 
 
526 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  33.69 
 
 
665 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  31.13 
 
 
627 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  31.33 
 
 
568 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  30.1 
 
 
621 aa  173  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  32.87 
 
 
535 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  30.61 
 
 
579 aa  157  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  29.91 
 
 
610 aa  154  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  28.24 
 
 
533 aa  150  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 
546 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  31.1 
 
 
580 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  30.38 
 
 
592 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  27.89 
 
 
521 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  30.21 
 
 
1219 aa  121  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  28.61 
 
 
517 aa  112  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  29.56 
 
 
535 aa  108  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  27.13 
 
 
1219 aa  104  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  26.14 
 
 
544 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  26.22 
 
 
535 aa  102  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  28.91 
 
 
513 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  28.91 
 
 
513 aa  97.8  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 
1224 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  28.16 
 
 
514 aa  94.7  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  25.81 
 
 
539 aa  94.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  28.27 
 
 
543 aa  94  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  26.75 
 
 
1263 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  26.75 
 
 
1184 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  26.75 
 
 
1168 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  27.38 
 
 
1209 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  23.72 
 
 
563 aa  90.5  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  26.26 
 
 
1184 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  28.18 
 
 
513 aa  88.6  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  28.57 
 
 
538 aa  81.6  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  28.02 
 
 
541 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  23.23 
 
 
700 aa  79.3  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  23.11 
 
 
522 aa  78.2  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2003  integral membrane protein MviN  28.87 
 
 
538 aa  77.8  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.965179  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1130  virulence factor MVIN family protein  27.96 
 
 
538 aa  76.6  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  27.39 
 
 
613 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2007  virulence factor MVIN family protein  27.93 
 
 
552 aa  74.3  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.4064  normal  0.087601 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  26.28 
 
 
520 aa  73.9  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  24.08 
 
 
545 aa  73.6  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1346  virulence factor MVIN family protein  27.84 
 
 
557 aa  73.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.817252  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  27.62 
 
 
573 aa  73.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  24.66 
 
 
530 aa  72.4  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  22.11 
 
 
534 aa  72.8  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  24.7 
 
 
529 aa  70.9  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  24.42 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  21.31 
 
 
521 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  25.44 
 
 
529 aa  68.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  26.16 
 
 
521 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  23.69 
 
 
529 aa  68.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  24.41 
 
 
521 aa  67.8  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13710  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  25.33 
 
 
588 aa  67.4  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.721621  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2027  hypothetical protein  25.06 
 
 
539 aa  67.4  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  25.93 
 
 
511 aa  67.4  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  25.13 
 
 
511 aa  67  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  24.84 
 
 
511 aa  67  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  24.68 
 
 
524 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  24.68 
 
 
524 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  24.68 
 
 
524 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  24.68 
 
 
524 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  24.68 
 
 
524 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  23.6 
 
 
526 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  25.56 
 
 
532 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  25.56 
 
 
521 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  31.49 
 
 
519 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  31.49 
 
 
519 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  31.49 
 
 
519 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  24.69 
 
 
519 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  21.89 
 
 
519 aa  64.7  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  31.49 
 
 
519 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  23.71 
 
 
521 aa  64.7  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  24.39 
 
 
525 aa  64.7  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  24.9 
 
 
555 aa  64.7  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  23.65 
 
 
508 aa  64.3  0.000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  26.81 
 
 
545 aa  64.3  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  24.83 
 
 
511 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  23.58 
 
 
511 aa  64.3  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>