More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2003 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2003  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 538 aa  1037    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.965179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1883  integral membrane protein MviN  38.57 
 
 		 492 aa  224  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.351763  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0981  integral membrane protein MviN  36.38 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  31.64 
 
 		 521 aa  169  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  32.1 
 
 		 530 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  32.02 
 
 		 530 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2444  integral membrane protein MviN  34.12 
 
 		 548 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410377  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  31.53 
 
 		 517 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  29.29 
 
 		 526 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  33.18 
 
 		 521 aa  154  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  31.54 
 
 		 528 aa  150  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  31.18 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  33.64 
 
 		 535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  32.37 
 
 		 535 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  32.59 
 
 		 535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  30.62 
 
 		 522 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  32.94 
 
 		 521 aa  146  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  30.06 
 
 		 526 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  31.33 
 
 		 516 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  30.4 
 
 		 522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  33.42 
 
 		 521 aa  139  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  30.39 
 
 		 529 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  31.63 
 
 		 522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  32.51 
 
 		 530 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0736  integral membrane protein MviN  31 
 
 		 539 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  31.81 
 
 		 534 aa  137  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1076  integral membrane protein MviN  30.69 
 
 		 606 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.656695  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  29.93 
 
 		 523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0924  integral membrane protein MviN  30.42 
 
 		 592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2513  integral membrane protein MviN  30.42 
 
 		 592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0127  integral membrane protein MviN  30.42 
 
 		 592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0678  integral membrane protein MviN  30.42 
 
 		 539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5882  virulence factor MVIN-like  30.63 
 
 		 516 aa  134  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.480668 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  29.48 
 
 		 523 aa  133  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  32.35 
 
 		 541 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  32.63 
 
 		 520 aa  133  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0342  integral membrane protein MviN  26.42 
 
 		 537 aa  133  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0378  integral membrane protein MviN  31.12 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0921  integral membrane protein MviN  31.12 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.432333  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0532  integral membrane protein MviN  29.51 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  32.61 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1938  integral membrane protein MviN  30.8 
 
 		 546 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.919423  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2574  integral membrane protein MviN  30.88 
 
 		 516 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2550  integral membrane protein MviN  30.88 
 
 		 516 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2599  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 516 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  31.55 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1580  virulence factor  32.63 
 
 		 536 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.716826  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  31.55 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  31.2 
 
 		 518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  32.02 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2469  integral membrane protein MviN  31.05 
 
 		 516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0186654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  29.45 
 
 		 522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  30.94 
 
 		 573 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  29.48 
 
 		 517 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  29.48 
 
 		 511 aa  127  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  31.32 
 
 		 512 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0746  integral membrane protein MviN  31.03 
 
 		 516 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.533432 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1523  integral membrane protein MviN  31.73 
 
 		 536 aa  127  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  29.41 
 
 		 511 aa  126  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  29.95 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  29.95 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  29.72 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  29.72 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  29.72 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  29.72 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  29.95 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  29.95 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  29.72 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  28.34 
 
 		 505 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3202  integral membrane protein MviN  29.52 
 
 		 516 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  29.66 
 
 		 545 aa  124  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  27.12 
 
 		 521 aa  124  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  23.68 
 
 		 525 aa  124  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  29.2 
 
 		 534 aa  123  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  32.53 
 
 		 517 aa  123  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  32.53 
 
 		 517 aa  123  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  29.43 
 
 		 511 aa  123  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  29.43 
 
 		 511 aa  123  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  29.66 
 
 		 498 aa  123  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  28.35 
 
 		 523 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  26.79 
 
 		 521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0760  virulence factor MVIN-like  30.4 
 
 		 516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 		 524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  29.58 
 
 		 521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  29.52 
 
 		 511 aa  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1472  integral membrane protein MviN  30.19 
 
 		 517 aa  121  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  29.52 
 
 		 508 aa  121  3e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  27.25 
 
 		 523 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  27.31 
 
 		 519 aa  121  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  28.78 
 
 		 539 aa  121  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  29.84 
 
 		 512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  30.58 
 
 		 524 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  27.58 
 
 		 525 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  31.12 
 
 		 511 aa  120  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2971  integral membrane protein MviN  29.88 
 
 		 525 aa  120  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000053192 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  27.38 
 
 		 519 aa  120  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  27.04 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  27.38 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  27.38 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>