297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0981 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0981  integral membrane protein MviN  100 
 
 
500 aa  954    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1883  integral membrane protein MviN  55.81 
 
 
492 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.351763  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2003  integral membrane protein MviN  37.72 
 
 
538 aa  227  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.965179  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  32.2 
 
 
534 aa  130  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  33.67 
 
 
524 aa  130  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  28.01 
 
 
511 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  35.51 
 
 
516 aa  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  28.63 
 
 
508 aa  124  3e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  29.44 
 
 
521 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  29.74 
 
 
513 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  27.62 
 
 
511 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  29.4 
 
 
522 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  27.79 
 
 
523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  27.19 
 
 
523 aa  118  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  26.79 
 
 
511 aa  117  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  27.16 
 
 
511 aa  117  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  31.66 
 
 
513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  27.63 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  29.07 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  27.95 
 
 
523 aa  115  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  30.17 
 
 
529 aa  115  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  27.03 
 
 
511 aa  114  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  29.25 
 
 
512 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1580  virulence factor  36.74 
 
 
536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.716826  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1523  integral membrane protein MviN  37.5 
 
 
536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  27.31 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  27.31 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  28.85 
 
 
501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  27.31 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  27.97 
 
 
516 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  27.77 
 
 
511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  30.44 
 
 
530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  27.31 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  27.31 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  26.85 
 
 
512 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  29.79 
 
 
517 aa  110  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 
512 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  29.79 
 
 
517 aa  110  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  30.56 
 
 
518 aa  110  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  32.5 
 
 
510 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  27.43 
 
 
530 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  27.67 
 
 
515 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  28.85 
 
 
514 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  29.68 
 
 
528 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  26.9 
 
 
542 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  27.43 
 
 
530 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  26.9 
 
 
511 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  28.48 
 
 
528 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  27.91 
 
 
515 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  28.1 
 
 
498 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  26.27 
 
 
511 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  26.27 
 
 
511 aa  107  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  26.27 
 
 
511 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  26.27 
 
 
511 aa  107  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  29.17 
 
 
512 aa  107  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  27.41 
 
 
514 aa  107  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  28.13 
 
 
521 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  26.02 
 
 
511 aa  107  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  26.27 
 
 
511 aa  106  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  26.27 
 
 
511 aa  106  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  26.27 
 
 
511 aa  106  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  26.27 
 
 
511 aa  106  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  26.27 
 
 
511 aa  106  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  27.48 
 
 
517 aa  106  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  28.03 
 
 
521 aa  106  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  27.95 
 
 
512 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  28.39 
 
 
517 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  25.39 
 
 
525 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  27.53 
 
 
519 aa  104  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  28.21 
 
 
519 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  27.75 
 
 
511 aa  104  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  29.73 
 
 
522 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  27.02 
 
 
519 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  30.13 
 
 
519 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  27.02 
 
 
519 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1590  integral membrane protein MviN  29.1 
 
 
521 aa  103  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.814029  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  29.18 
 
 
535 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  29.18 
 
 
535 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  30.53 
 
 
521 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  30.48 
 
 
521 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  28.08 
 
 
519 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  29.84 
 
 
524 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  28.07 
 
 
525 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  28.29 
 
 
519 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  28.64 
 
 
519 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  27.46 
 
 
519 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  29.24 
 
 
522 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  28.29 
 
 
519 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  28.29 
 
 
519 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  30.2 
 
 
541 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  27.53 
 
 
519 aa  101  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  27.63 
 
 
613 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  29.33 
 
 
495 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  32.95 
 
 
516 aa  101  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  28.38 
 
 
512 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  30.31 
 
 
514 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  27.71 
 
 
521 aa  100  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  29.44 
 
 
535 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  32.67 
 
 
516 aa  100  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  26.3 
 
 
532 aa  100  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>