More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1883 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1883  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 492 aa  951    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.351763  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0981  integral membrane protein MviN  55.31 
 
 		 500 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2003  integral membrane protein MviN  38.38 
 
 		 538 aa  249  9e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.965179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  30.31 
 
 		 516 aa  159  7e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  29 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  29.56 
 
 		 511 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  29.23 
 
 		 524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  28.1 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  29.23 
 
 		 524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  29.86 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  29.23 
 
 		 524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  29.23 
 
 		 524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  29.23 
 
 		 524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  27.91 
 
 		 511 aa  134  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  28.92 
 
 		 511 aa  133  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  28.77 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  30.04 
 
 		 513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  29.1 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  28.9 
 
 		 511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  28.9 
 
 		 511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  28.9 
 
 		 511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  28.9 
 
 		 511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  28.9 
 
 		 511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  28.9 
 
 		 511 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  28.9 
 
 		 511 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  28.9 
 
 		 511 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  28.9 
 
 		 511 aa  130  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  28.73 
 
 		 511 aa  130  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  28.51 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  28.63 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  29.24 
 
 		 530 aa  128  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  28.97 
 
 		 511 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  29.74 
 
 		 512 aa  126  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  29.46 
 
 		 529 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  28.27 
 
 		 498 aa  124  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  28 
 
 		 508 aa  124  5e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  30.02 
 
 		 517 aa  123  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  30.02 
 
 		 517 aa  123  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  27.95 
 
 		 512 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  28.92 
 
 		 512 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  28.92 
 
 		 512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  27.62 
 
 		 512 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  28.28 
 
 		 523 aa  121  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  29.77 
 
 		 534 aa  120  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  27.97 
 
 		 523 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  27.18 
 
 		 515 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  25.19 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  25.39 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  28.02 
 
 		 542 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  28.02 
 
 		 511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  27.14 
 
 		 522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  26.82 
 
 		 522 aa  117  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  27.31 
 
 		 512 aa  117  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  25.84 
 
 		 517 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  28.33 
 
 		 573 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  28.07 
 
 		 526 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  28.99 
 
 		 518 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  27.18 
 
 		 515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  27.99 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  29.46 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  31.9 
 
 		 511 aa  114  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  29.59 
 
 		 524 aa  113  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  29.44 
 
 		 521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  27.54 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0342  integral membrane protein MviN  25.74 
 
 		 537 aa  111  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5882  virulence factor MVIN-like  26.79 
 
 		 516 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.480668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  27.6 
 
 		 521 aa  111  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2469  integral membrane protein MviN  27.47 
 
 		 516 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0186654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  29.56 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  26.81 
 
 		 521 aa  110  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  26.38 
 
 		 532 aa  110  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2574  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 		 516 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2550  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 		 516 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  30.24 
 
 		 528 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  28.72 
 
 		 511 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1938  integral membrane protein MviN  26.91 
 
 		 546 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.919423  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  28.04 
 
 		 517 aa  110  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  27.23 
 
 		 519 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  27.9 
 
 		 521 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  26.43 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2599  integral membrane protein MviN  27.71 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 		 613 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  26.68 
 
 		 525 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  27.22 
 
 		 534 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 		 523 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  25.12 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1838  integral membrane protein MviN  27.98 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  26.11 
 
 		 519 aa  108  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  27.16 
 
 		 519 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  27.79 
 
 		 495 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  30.38 
 
 		 509 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  27.16 
 
 		 519 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2513  integral membrane protein MviN  27.6 
 
 		 592 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3004  integral membrane protein MviN  26.57 
 
 		 521 aa  107  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0127  integral membrane protein MviN  27.6 
 
 		 592 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  25.16 
 
 		 519 aa  107  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0678  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 		 539 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0378  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 		 516 aa  106  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0924  integral membrane protein MviN  27.6 
 
 		 592 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0921  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 		 516 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.432333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>