More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2007 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2007  virulence factor MVIN family protein  100 
 
 
552 aa  1015    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.4064  normal  0.087601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6052  membrane protein putative virulence factor-like protein  54.38 
 
 
549 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612093  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2175  virulence factor MVIN family protein  57.75 
 
 
527 aa  432  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134074  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2027  hypothetical protein  48.37 
 
 
539 aa  330  4e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  51.61 
 
 
541 aa  317  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  47.47 
 
 
648 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3021  virulence factor MVIN family protein  50.4 
 
 
540 aa  306  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.378839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  47.17 
 
 
538 aa  286  5.999999999999999e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3143  virulence factor MVIN family protein  48.76 
 
 
532 aa  280  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0110938  normal  0.770926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1346  virulence factor MVIN family protein  43.89 
 
 
557 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.817252  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1130  virulence factor MVIN family protein  40.52 
 
 
538 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1663  virulence factor MVIN family protein  43.48 
 
 
541 aa  228  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.45805  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1908  virulence factor MVIN family protein  45.04 
 
 
567 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146225  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  48.67 
 
 
964 aa  223  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1917  virulence factor MVIN family protein  42.86 
 
 
568 aa  213  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.731846  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13710  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  39.25 
 
 
588 aa  199  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.721621  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  36 
 
 
517 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  29.76 
 
 
559 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  30.65 
 
 
526 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  29.73 
 
 
523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  28.76 
 
 
534 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  27.95 
 
 
521 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  29.75 
 
 
621 aa  120  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  29.93 
 
 
657 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  28.67 
 
 
532 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  27.43 
 
 
627 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  33.75 
 
 
533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  28.25 
 
 
568 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  33.81 
 
 
535 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  29.09 
 
 
521 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.54 
 
 
535 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  29.16 
 
 
1217 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  30.02 
 
 
918 aa  107  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  27.84 
 
 
570 aa  102  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  28.7 
 
 
524 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  25.88 
 
 
552 aa  100  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  28.93 
 
 
674 aa  99.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 
610 aa  99.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  29.28 
 
 
552 aa  99.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  27.84 
 
 
700 aa  97.8  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  29 
 
 
525 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  29.59 
 
 
1219 aa  94.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  31.68 
 
 
535 aa  94.4  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  25.31 
 
 
563 aa  94  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  26.7 
 
 
565 aa  94  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  29.85 
 
 
580 aa  94  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  26.6 
 
 
613 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  28.08 
 
 
530 aa  92  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  29.24 
 
 
529 aa  90.9  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  29.59 
 
 
545 aa  90.5  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  28.29 
 
 
530 aa  90.1  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  28.08 
 
 
517 aa  89.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  29.32 
 
 
535 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  30.21 
 
 
546 aa  89.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  26.02 
 
 
575 aa  89  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  28.8 
 
 
521 aa  88.2  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  27.83 
 
 
569 aa  88.2  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  28.17 
 
 
534 aa  87.4  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  27.41 
 
 
544 aa  87.8  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.16 
 
 
579 aa  87  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  28.87 
 
 
517 aa  87.4  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  28.42 
 
 
580 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  25.66 
 
 
539 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  26.44 
 
 
526 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  28.66 
 
 
535 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0736  virulence factor MVIN family protein  26.75 
 
 
537 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  29.19 
 
 
530 aa  84.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  28.9 
 
 
535 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  28.66 
 
 
1219 aa  82.8  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  27.16 
 
 
521 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  28.9 
 
 
516 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  28.9 
 
 
521 aa  82.8  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  30.3 
 
 
520 aa  82  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  30.35 
 
 
1652 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  31.09 
 
 
573 aa  80.9  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  27.23 
 
 
560 aa  81.3  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  26.19 
 
 
524 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  26.19 
 
 
524 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  26.19 
 
 
524 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  26.19 
 
 
524 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  26.19 
 
 
524 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  24.94 
 
 
519 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  29.85 
 
 
511 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  24.94 
 
 
519 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  24.94 
 
 
519 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  24.79 
 
 
549 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  28.91 
 
 
498 aa  80.1  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  30.15 
 
 
899 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  24.69 
 
 
519 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  25.06 
 
 
521 aa  79.7  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  29.21 
 
 
592 aa  80.1  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 
523 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  26.43 
 
 
526 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  26.58 
 
 
522 aa  79.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  26.18 
 
 
511 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  24.57 
 
 
514 aa  78.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1472  integral membrane protein MviN  29.94 
 
 
517 aa  78.6  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  28.3 
 
 
512 aa  78.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  25.7 
 
 
531 aa  78.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  27.66 
 
 
511 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>