272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1917 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1908  virulence factor MVIN family protein  87.68 
 
 		 567 aa  732    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146225  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1917  virulence factor MVIN family protein  100 
 
 		 568 aa  1044    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.731846  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  51.11 
 
 		 541 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2175  virulence factor MVIN family protein  47.48 
 
 		 527 aa  299  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  43.68 
 
 		 648 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6052  membrane protein putative virulence factor-like protein  43.43 
 
 		 549 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  44.74 
 
 		 538 aa  249  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2007  virulence factor MVIN family protein  44.52 
 
 		 552 aa  244  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.4064  normal  0.087601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1346  virulence factor MVIN family protein  42.52 
 
 		 557 aa  234  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.817252  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2027  hypothetical protein  42.12 
 
 		 539 aa  227  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1130  virulence factor MVIN family protein  40.6 
 
 		 538 aa  226  7e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  47.94 
 
 		 964 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3021  virulence factor MVIN family protein  42.32 
 
 		 540 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.378839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3143  virulence factor MVIN family protein  42.29 
 
 		 532 aa  209  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0110938  normal  0.770926 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13710  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  36.62 
 
 		 588 aa  186  8e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.721621  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1663  virulence factor MVIN family protein  44.5 
 
 		 541 aa  181  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.45805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  30.73 
 
 		 657 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  31.1 
 
 		 534 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  34.21 
 
 		 517 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  29.21 
 
 		 918 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  34.21 
 
 		 535 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 		 523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  28.45 
 
 		 521 aa  103  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  29.64 
 
 		 627 aa  99.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 		 559 aa  98.2  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  32.12 
 
 		 533 aa  97.1  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  31.78 
 
 		 674 aa  96.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  28.89 
 
 		 532 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  26.98 
 
 		 621 aa  95.1  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  34.58 
 
 		 535 aa  95.1  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  27.11 
 
 		 700 aa  95.1  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  23.82 
 
 		 563 aa  94  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  28.18 
 
 		 610 aa  94  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  29.38 
 
 		 580 aa  91.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.76 
 
 		 535 aa  90.1  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  28.07 
 
 		 715 aa  88.6  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  29.44 
 
 		 524 aa  88.2  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  27.08 
 
 		 526 aa  87  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  27.81 
 
 		 521 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  27.52 
 
 		 568 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  27.59 
 
 		 515 aa  85.9  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  27.59 
 
 		 515 aa  85.1  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  24.69 
 
 		 525 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  28.03 
 
 		 708 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  29.5 
 
 		 560 aa  82.4  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  27.49 
 
 		 552 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  25.99 
 
 		 1217 aa  82.4  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  26.03 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  24.56 
 
 		 494 aa  80.5  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  30.15 
 
 		 570 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  30.35 
 
 		 546 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0736  virulence factor MVIN family protein  25.48 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  25.88 
 
 		 516 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  25.06 
 
 		 529 aa  77.4  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0370  integral membrane protein MviN  27.07 
 
 		 519 aa  77  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.501558 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2468  integral membrane protein MviN  28.31 
 
 		 529 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  25.86 
 
 		 516 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  28.25 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  29.07 
 
 		 545 aa  74.7  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  27.07 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  25.25 
 
 		 522 aa  73.6  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  29.57 
 
 		 573 aa  73.6  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  21.97 
 
 		 544 aa  73.6  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  28.63 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  29.13 
 
 		 526 aa  73.2  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  30 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0707  integral membrane protein MviN  26.75 
 
 		 514 aa  72.8  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1776  integral membrane protein MviN  28.03 
 
 		 521 aa  72.4  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  26.38 
 
 		 526 aa  72  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  22.25 
 
 		 549 aa  72  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  26.02 
 
 		 514 aa  72  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  30 
 
 		 535 aa  71.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  29.37 
 
 		 614 aa  71.2  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1882  integral membrane protein MviN  29.69 
 
 		 527 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  19.64 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  25.83 
 
 		 531 aa  70.9  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3067  virulence factor MVIN family protein  29.23 
 
 		 538 aa  70.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  24.69 
 
 		 518 aa  70.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  24.57 
 
 		 516 aa  70.9  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  24.3 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  24.55 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  30.25 
 
 		 535 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  27.1 
 
 		 517 aa  70.5  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  25.94 
 
 		 521 aa  70.1  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  25.88 
 
 		 534 aa  70.1  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  29.18 
 
 		 556 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1033  integral membrane protein MviN  26.22 
 
 		 522 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.105478  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  26.41 
 
 		 528 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3077  integral membrane protein MviN  30.38 
 
 		 543 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000112933  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  26.72 
 
 		 533 aa  68.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  31.35 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  24.95 
 
 		 526 aa  68.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  23.6 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  24.08 
 
 		 516 aa  67.8  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  29.23 
 
 		 1184 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  27.62 
 
 		 517 aa  67.4  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  27.13 
 
 		 1219 aa  67.4  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  26.26 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  24.25 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  25.91 
 
 		 511 aa  66.6  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>