279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6052 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6052  membrane protein putative virulence factor-like protein  100 
 
 
549 aa  1044    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612093  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2175  virulence factor MVIN family protein  54.62 
 
 
527 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134074  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2007  virulence factor MVIN family protein  54.95 
 
 
552 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.4064  normal  0.087601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  43.67 
 
 
648 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2027  hypothetical protein  45.47 
 
 
539 aa  301  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3021  virulence factor MVIN family protein  46.54 
 
 
540 aa  300  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.378839 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1130  virulence factor MVIN family protein  41.01 
 
 
538 aa  274  4.0000000000000004e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  43.1 
 
 
541 aa  273  9e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1346  virulence factor MVIN family protein  43.95 
 
 
557 aa  270  7e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.817252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  43.51 
 
 
538 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3143  virulence factor MVIN family protein  46.05 
 
 
532 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0110938  normal  0.770926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  47.8 
 
 
964 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1908  virulence factor MVIN family protein  41.51 
 
 
567 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146225  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1663  virulence factor MVIN family protein  41.81 
 
 
541 aa  209  7e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.45805  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1917  virulence factor MVIN family protein  42.37 
 
 
568 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.731846  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13710  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  35.42 
 
 
588 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.721621  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  33.7 
 
 
517 aa  133  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  27.87 
 
 
657 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  26.67 
 
 
535 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  27.97 
 
 
532 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  29.91 
 
 
552 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  26.93 
 
 
610 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 
526 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  28.64 
 
 
918 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  30.02 
 
 
535 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  25.86 
 
 
559 aa  103  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  26.17 
 
 
534 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  27.31 
 
 
627 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 
1217 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  28.71 
 
 
674 aa  98.2  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  31.24 
 
 
535 aa  96.3  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  27.57 
 
 
521 aa  95.9  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  27.33 
 
 
523 aa  94.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  26.81 
 
 
521 aa  94  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 
533 aa  93.2  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  27.15 
 
 
521 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  24.45 
 
 
563 aa  92.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  23.47 
 
 
700 aa  91.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  25.2 
 
 
498 aa  89.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  27.92 
 
 
568 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  26.35 
 
 
544 aa  87.4  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  26.48 
 
 
552 aa  87  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 
524 aa  85.5  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  30.69 
 
 
580 aa  85.1  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0314  integral membrane protein MviN  28.27 
 
 
562 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  26.57 
 
 
1219 aa  83.2  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  28.44 
 
 
1209 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  25.97 
 
 
570 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  27.07 
 
 
1224 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  26.67 
 
 
621 aa  82  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  26.18 
 
 
526 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1882  integral membrane protein MviN  27.42 
 
 
527 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  26.49 
 
 
546 aa  80.9  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  26.82 
 
 
1184 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  29.2 
 
 
534 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0736  virulence factor MVIN family protein  27.93 
 
 
537 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  24.25 
 
 
529 aa  78.2  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0707  integral membrane protein MviN  24.07 
 
 
514 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  25.63 
 
 
519 aa  76.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  27.25 
 
 
565 aa  76.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  25.74 
 
 
560 aa  74.3  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  27.13 
 
 
592 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  26.6 
 
 
513 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  25.59 
 
 
530 aa  73.9  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  24.81 
 
 
521 aa  73.9  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  23.24 
 
 
575 aa  73.6  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  25.9 
 
 
1263 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  25.25 
 
 
522 aa  73.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  25.9 
 
 
1184 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  25.9 
 
 
1168 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  26.67 
 
 
511 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  26.67 
 
 
511 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  27.1 
 
 
580 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  26.67 
 
 
511 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  26.67 
 
 
511 aa  72.4  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  26.67 
 
 
511 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3067  virulence factor MVIN family protein  25.98 
 
 
538 aa  72.8  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  26.67 
 
 
511 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  26.67 
 
 
511 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  26.67 
 
 
511 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  26.67 
 
 
511 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  24.46 
 
 
501 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  24.22 
 
 
539 aa  72  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  27.23 
 
 
513 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  25.79 
 
 
526 aa  71.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0543  integral membrane protein MviN  29.11 
 
 
527 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  28.49 
 
 
521 aa  71.6  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  27.68 
 
 
512 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  27.25 
 
 
514 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  25.43 
 
 
530 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 
528 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0370  integral membrane protein MviN  29.1 
 
 
519 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.501558 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  23.53 
 
 
522 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  29.02 
 
 
535 aa  70.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  26 
 
 
521 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  27.23 
 
 
513 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  25.17 
 
 
1219 aa  70.1  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  25.45 
 
 
517 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  24.94 
 
 
517 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  25.11 
 
 
512 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>