283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3143 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3143  virulence factor MVIN family protein  100 
 
 
532 aa  957    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0110938  normal  0.770926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2175  virulence factor MVIN family protein  50.21 
 
 
527 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6052  membrane protein putative virulence factor-like protein  45.91 
 
 
549 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612093  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2007  virulence factor MVIN family protein  48.32 
 
 
552 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.4064  normal  0.087601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  44.89 
 
 
648 aa  259  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  45.59 
 
 
541 aa  233  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2027  hypothetical protein  42.05 
 
 
539 aa  232  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  42.46 
 
 
538 aa  229  8e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1346  virulence factor MVIN family protein  41.13 
 
 
557 aa  226  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.817252  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3021  virulence factor MVIN family protein  44.68 
 
 
540 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.378839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1917  virulence factor MVIN family protein  43.76 
 
 
568 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.731846  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1908  virulence factor MVIN family protein  43.88 
 
 
567 aa  200  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146225  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1130  virulence factor MVIN family protein  40.12 
 
 
538 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  45.85 
 
 
964 aa  191  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13710  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  37.68 
 
 
588 aa  182  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.721621  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1663  virulence factor MVIN family protein  41.38 
 
 
541 aa  166  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.45805  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  30.9 
 
 
532 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  32.16 
 
 
918 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  32.2 
 
 
657 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  29.65 
 
 
534 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  30.79 
 
 
546 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  29.29 
 
 
1217 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  31.98 
 
 
517 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  27.01 
 
 
523 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  29.93 
 
 
560 aa  102  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  31.36 
 
 
533 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  28.11 
 
 
526 aa  100  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  28.64 
 
 
521 aa  99  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  25.44 
 
 
544 aa  98.6  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  28.1 
 
 
627 aa  98.6  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  29.8 
 
 
524 aa  98.2  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  27.87 
 
 
610 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  31.54 
 
 
552 aa  94.7  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  30.19 
 
 
674 aa  94.7  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  30.08 
 
 
521 aa  94  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  32.41 
 
 
535 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  28.36 
 
 
1219 aa  93.6  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  26 
 
 
700 aa  92.8  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  23.75 
 
 
563 aa  92.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  28.39 
 
 
580 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.02 
 
 
535 aa  92  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  26.11 
 
 
568 aa  90.5  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  29.61 
 
 
580 aa  90.5  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  27.78 
 
 
526 aa  89  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  28.32 
 
 
545 aa  87.4  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  26.58 
 
 
621 aa  87  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 
613 aa  86.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  27.43 
 
 
592 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  24.07 
 
 
598 aa  85.9  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  27.86 
 
 
559 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  29.16 
 
 
573 aa  85.9  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  25.45 
 
 
521 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  31.25 
 
 
535 aa  84.7  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  25.38 
 
 
521 aa  84.3  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  26.46 
 
 
1219 aa  84  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  29.72 
 
 
520 aa  83.2  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  27.14 
 
 
529 aa  83.2  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  27.81 
 
 
530 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  28.39 
 
 
1184 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  25.41 
 
 
575 aa  81.6  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  29.65 
 
 
1209 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  27.23 
 
 
545 aa  81.6  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  27.22 
 
 
530 aa  80.9  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  28.19 
 
 
570 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  25.93 
 
 
516 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  27.36 
 
 
539 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4685  virulence factor MVIN family protein  26.34 
 
 
553 aa  79  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  25.68 
 
 
534 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  29.8 
 
 
541 aa  77.4  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  28.19 
 
 
532 aa  77.4  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0707  integral membrane protein MviN  23.83 
 
 
514 aa  77  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1776  integral membrane protein MviN  27.5 
 
 
521 aa  77  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  28.19 
 
 
521 aa  77  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  26.26 
 
 
552 aa  77  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  25.74 
 
 
517 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  28.8 
 
 
1224 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  25.12 
 
 
521 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 
715 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  26.25 
 
 
549 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  29.71 
 
 
614 aa  75.1  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  26.39 
 
 
518 aa  74.3  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  24.5 
 
 
521 aa  73.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  22.77 
 
 
505 aa  73.9  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  31.12 
 
 
535 aa  73.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  23.63 
 
 
525 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 
899 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  28.5 
 
 
511 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0736  virulence factor MVIN family protein  25.81 
 
 
537 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3067  virulence factor MVIN family protein  29.12 
 
 
538 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  30.88 
 
 
535 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  24.69 
 
 
521 aa  72  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  31.52 
 
 
535 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  21.71 
 
 
531 aa  70.5  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1472  integral membrane protein MviN  28.62 
 
 
517 aa  70.1  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  23.61 
 
 
522 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  25.06 
 
 
517 aa  69.3  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  28 
 
 
1263 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  28 
 
 
1184 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  27.81 
 
 
517 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  28 
 
 
1168 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>