288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5413 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  100 
 
 
648 aa  1248    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2175  virulence factor MVIN family protein  50.96 
 
 
527 aa  350  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6052  membrane protein putative virulence factor-like protein  46.36 
 
 
549 aa  333  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612093  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2007  virulence factor MVIN family protein  47.44 
 
 
552 aa  299  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.4064  normal  0.087601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  46.1 
 
 
541 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1346  virulence factor MVIN family protein  44.68 
 
 
557 aa  268  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.817252  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2027  hypothetical protein  42.2 
 
 
539 aa  264  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1908  virulence factor MVIN family protein  44.75 
 
 
567 aa  252  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146225  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  43.78 
 
 
538 aa  251  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1130  virulence factor MVIN family protein  41.55 
 
 
538 aa  250  7e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3021  virulence factor MVIN family protein  45.29 
 
 
540 aa  248  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.378839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3143  virulence factor MVIN family protein  44.47 
 
 
532 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0110938  normal  0.770926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1917  virulence factor MVIN family protein  42.63 
 
 
568 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.731846  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13710  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  39.67 
 
 
588 aa  213  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.721621  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  45.19 
 
 
964 aa  212  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1663  virulence factor MVIN family protein  42.14 
 
 
541 aa  200  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.45805  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  31.16 
 
 
657 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  26.78 
 
 
700 aa  120  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  26.63 
 
 
544 aa  120  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  29.81 
 
 
559 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  29.24 
 
 
918 aa  118  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  27.37 
 
 
627 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  32.33 
 
 
533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  24.88 
 
 
563 aa  109  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  28.44 
 
 
1217 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  30.68 
 
 
674 aa  107  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  27.05 
 
 
521 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  27.39 
 
 
532 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 
560 aa  105  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  27.32 
 
 
534 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  25.26 
 
 
610 aa  103  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  26.86 
 
 
621 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  32.41 
 
 
517 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  31.87 
 
 
535 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  29.3 
 
 
552 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  27.03 
 
 
1184 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  27.27 
 
 
526 aa  95.1  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  26.62 
 
 
570 aa  95.1  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  25.32 
 
 
523 aa  94.7  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  28.44 
 
 
580 aa  93.6  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  30.72 
 
 
535 aa  92.4  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  27.09 
 
 
1219 aa  92.8  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  28.99 
 
 
535 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  29.26 
 
 
535 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  25.94 
 
 
899 aa  88.6  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  26.54 
 
 
1263 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  25.9 
 
 
1224 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  28.48 
 
 
535 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  26.29 
 
 
1219 aa  85.5  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  26.07 
 
 
613 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  25.85 
 
 
1209 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  24.52 
 
 
521 aa  83.6  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  28.82 
 
 
546 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  26.13 
 
 
1184 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  26.13 
 
 
1168 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0736  virulence factor MVIN family protein  25.73 
 
 
537 aa  82  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 
552 aa  82  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  26.71 
 
 
535 aa  81.6  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  25.67 
 
 
526 aa  80.9  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  28.02 
 
 
498 aa  80.9  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  26.85 
 
 
511 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 
511 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 
511 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 
511 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 
511 aa  80.5  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  26.85 
 
 
511 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 
511 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 
511 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  25.99 
 
 
568 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 
511 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  27.92 
 
 
511 aa  78.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 
524 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 
524 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 
524 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 
524 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 
524 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  26.39 
 
 
522 aa  77  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  22.12 
 
 
519 aa  75.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  27.71 
 
 
573 aa  74.7  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  26.01 
 
 
708 aa  73.9  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  23.38 
 
 
534 aa  73.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  28.69 
 
 
614 aa  72.4  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  26.39 
 
 
508 aa  72.8  0.00000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  26.52 
 
 
521 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  27.27 
 
 
521 aa  72.4  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  26.23 
 
 
516 aa  72  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  28.89 
 
 
541 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  26.65 
 
 
530 aa  71.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  26.43 
 
 
715 aa  70.9  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  22.68 
 
 
519 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  26.4 
 
 
530 aa  70.5  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  24.7 
 
 
575 aa  70.5  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  23.96 
 
 
525 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 
511 aa  70.1  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  30.83 
 
 
522 aa  70.1  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1882  integral membrane protein MviN  27.22 
 
 
527 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  27.78 
 
 
512 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  26.47 
 
 
511 aa  69.7  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  27.78 
 
 
512 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  27.66 
 
 
512 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>