186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13710 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_13710  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  100 
 
 
588 aa  1104    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.721621  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  43.17 
 
 
538 aa  254  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1346  virulence factor MVIN family protein  39.96 
 
 
557 aa  252  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.817252  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  43.91 
 
 
964 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1130  virulence factor MVIN family protein  37.12 
 
 
538 aa  233  8.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  39.67 
 
 
648 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6052  membrane protein putative virulence factor-like protein  35.21 
 
 
549 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612093  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2175  virulence factor MVIN family protein  36.5 
 
 
527 aa  200  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134074  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2007  virulence factor MVIN family protein  37.94 
 
 
552 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.4064  normal  0.087601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1663  virulence factor MVIN family protein  40.45 
 
 
541 aa  188  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.45805  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  40.34 
 
 
541 aa  181  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1908  virulence factor MVIN family protein  38.53 
 
 
567 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146225  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3143  virulence factor MVIN family protein  37.08 
 
 
532 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0110938  normal  0.770926 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2027  hypothetical protein  36.85 
 
 
539 aa  169  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1917  virulence factor MVIN family protein  37.1 
 
 
568 aa  163  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.731846  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3021  virulence factor MVIN family protein  36.01 
 
 
540 aa  144  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.378839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  31.17 
 
 
674 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  31.52 
 
 
517 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 
918 aa  118  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  29.06 
 
 
657 aa  117  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  27.19 
 
 
534 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  28.09 
 
 
1217 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  26.29 
 
 
526 aa  98.6  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  26.64 
 
 
532 aa  96.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  23.97 
 
 
544 aa  96.3  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  26.85 
 
 
627 aa  94.4  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  22.38 
 
 
563 aa  94.4  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  28.73 
 
 
570 aa  92  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  28.6 
 
 
1219 aa  90.9  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  32.12 
 
 
533 aa  90.1  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  24.74 
 
 
535 aa  89.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  22.97 
 
 
700 aa  87.4  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  25.74 
 
 
621 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  30.83 
 
 
535 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  26.06 
 
 
568 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  27.93 
 
 
535 aa  82.4  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  25.71 
 
 
1219 aa  81.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  26.17 
 
 
899 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  26.13 
 
 
521 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  27.75 
 
 
580 aa  78.2  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  26.84 
 
 
569 aa  77.8  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 
559 aa  76.6  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  24.43 
 
 
613 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  26.7 
 
 
560 aa  73.9  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  25.84 
 
 
610 aa  72  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  26.68 
 
 
565 aa  70.1  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  24.77 
 
 
523 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1370  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 
512 aa  63.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000411577  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  27.23 
 
 
552 aa  63.2  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  25.87 
 
 
715 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  26.73 
 
 
530 aa  62.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  24.89 
 
 
529 aa  62  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  24.94 
 
 
533 aa  61.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  23.33 
 
 
534 aa  61.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2971  integral membrane protein MviN  23.81 
 
 
525 aa  60.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000053192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  25.52 
 
 
509 aa  60.5  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  26.58 
 
 
552 aa  59.3  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1273  integral membrane protein MviN  24.23 
 
 
507 aa  59.7  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5302  integral membrane protein MviN  29.15 
 
 
509 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  24.19 
 
 
516 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  24.46 
 
 
522 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  23.96 
 
 
522 aa  58.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  24.55 
 
 
543 aa  57.8  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  25.79 
 
 
665 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  28.42 
 
 
546 aa  57  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  25.61 
 
 
512 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  24.4 
 
 
528 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  25.63 
 
 
516 aa  57  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  24.21 
 
 
598 aa  56.6  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  25.73 
 
 
525 aa  56.6  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  23.32 
 
 
511 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  23.32 
 
 
511 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  23.32 
 
 
511 aa  55.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  23.91 
 
 
524 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  23.32 
 
 
511 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  23.32 
 
 
511 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  23.91 
 
 
524 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  23.91 
 
 
524 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  23.91 
 
 
524 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  23.32 
 
 
511 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  23.91 
 
 
524 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  23.32 
 
 
511 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  23.32 
 
 
511 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  23.32 
 
 
511 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  25.57 
 
 
519 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  24.61 
 
 
515 aa  55.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0342  integral membrane protein MviN  21.73 
 
 
537 aa  54.7  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  24.51 
 
 
525 aa  54.3  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  25.87 
 
 
708 aa  54.3  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0452  integral membrane protein MviN  24.73 
 
 
526 aa  53.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  25.52 
 
 
521 aa  53.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  23.31 
 
 
511 aa  53.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  24.84 
 
 
1184 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  23.29 
 
 
512 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  23.54 
 
 
521 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  24.8 
 
 
575 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3067  virulence factor MVIN family protein  24.8 
 
 
538 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  25.07 
 
 
508 aa  52  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1882  integral membrane protein MviN  24.94 
 
 
527 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  24.23 
 
 
511 aa  52  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>