More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39630 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  100 
 
 
610 aa  1204    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  51.06 
 
 
521 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  45.16 
 
 
1217 aa  395  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  40.88 
 
 
1219 aa  365  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  44.36 
 
 
674 aa  362  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  40.61 
 
 
1219 aa  358  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  42.34 
 
 
1209 aa  333  5e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  44.79 
 
 
1184 aa  332  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  43.31 
 
 
1224 aa  324  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  41.92 
 
 
1168 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  44.3 
 
 
1184 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  44.3 
 
 
1263 aa  317  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  35.13 
 
 
657 aa  275  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  38.03 
 
 
534 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  37.99 
 
 
580 aa  265  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  35.41 
 
 
546 aa  263  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  35.4 
 
 
918 aa  263  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  38.49 
 
 
592 aa  257  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  35.14 
 
 
621 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  33.63 
 
 
627 aa  253  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  35.66 
 
 
568 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  36.76 
 
 
535 aa  252  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  36.74 
 
 
526 aa  247  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  35.08 
 
 
532 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  36.61 
 
 
559 aa  243  7.999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  35.58 
 
 
533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  33.08 
 
 
899 aa  227  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  35.25 
 
 
570 aa  220  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 
552 aa  216  8e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  34.42 
 
 
560 aa  208  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  33.55 
 
 
580 aa  198  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  36.78 
 
 
665 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  32.95 
 
 
565 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  31.74 
 
 
715 aa  180  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  33.19 
 
 
1652 aa  170  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  32.02 
 
 
708 aa  170  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  30.58 
 
 
552 aa  169  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  29.77 
 
 
598 aa  163  9e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  31.03 
 
 
575 aa  152  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  30.18 
 
 
569 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  25.63 
 
 
535 aa  147  6e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.67 
 
 
579 aa  145  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  29.94 
 
 
535 aa  140  6e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  25.53 
 
 
700 aa  140  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  29.88 
 
 
544 aa  138  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  25.17 
 
 
563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  32.32 
 
 
517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  29.48 
 
 
511 aa  130  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  27.65 
 
 
522 aa  127  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 
614 aa  127  7e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  28.71 
 
 
511 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  28.5 
 
 
512 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  27.62 
 
 
524 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  27.62 
 
 
524 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  27.62 
 
 
524 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 
512 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  27.62 
 
 
524 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  27.62 
 
 
524 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 
511 aa  121  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  26.46 
 
 
521 aa  120  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  27.47 
 
 
511 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  27.47 
 
 
511 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  27.47 
 
 
511 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  27.47 
 
 
511 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  27.23 
 
 
511 aa  117  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  27.23 
 
 
511 aa  117  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  27.23 
 
 
511 aa  117  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  27.23 
 
 
511 aa  117  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  27.23 
 
 
511 aa  117  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  27.83 
 
 
511 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  27.67 
 
 
512 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  27.67 
 
 
512 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  27.75 
 
 
526 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  29.85 
 
 
498 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  26.12 
 
 
511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  27.82 
 
 
521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  27.86 
 
 
528 aa  112  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  27.09 
 
 
511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  28.78 
 
 
522 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  27.8 
 
 
513 aa  111  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  24.55 
 
 
494 aa  110  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  28.64 
 
 
522 aa  110  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  25.74 
 
 
521 aa  110  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  28.64 
 
 
512 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  27.29 
 
 
523 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  27.46 
 
 
508 aa  108  2e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  27.41 
 
 
511 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  26.32 
 
 
512 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  27.06 
 
 
542 aa  108  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  28.12 
 
 
521 aa  107  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  27.23 
 
 
513 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  27.97 
 
 
529 aa  107  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  29.32 
 
 
509 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  26.97 
 
 
513 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  26.6 
 
 
513 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  27.69 
 
 
517 aa  106  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  27.03 
 
 
514 aa  105  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  28.13 
 
 
524 aa  105  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  28.16 
 
 
512 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  27.52 
 
 
521 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>