More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26920 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 560 aa  1103    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  44.3 
 
 		 570 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  39.96 
 
 		 565 aa  322  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  44.7 
 
 		 580 aa  322  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  34.73 
 
 		 552 aa  302  9e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  40.8 
 
 		 1652 aa  273  5.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  35.22 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  36.91 
 
 		 899 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  37.78 
 
 		 534 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  35.56 
 
 		 598 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  37.64 
 
 		 569 aa  250  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  38.44 
 
 		 674 aa  249  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  35.99 
 
 		 552 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  36.8 
 
 		 614 aa  248  3e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  33.39 
 
 		 715 aa  244  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  35.68 
 
 		 708 aa  235  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  35.38 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  35.91 
 
 		 559 aa  224  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 657 aa  223  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  36.17 
 
 		 665 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  34.95 
 
 		 610 aa  213  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  34.88 
 
 		 526 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  33.62 
 
 		 535 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  34.88 
 
 		 533 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  31.49 
 
 		 568 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  33.04 
 
 		 592 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  33.16 
 
 		 580 aa  198  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  33.61 
 
 		 1217 aa  197  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  34.2 
 
 		 621 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  33.98 
 
 		 546 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  32.27 
 
 		 627 aa  192  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  32.62 
 
 		 579 aa  187  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  32.47 
 
 		 521 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  33.89 
 
 		 1219 aa  186  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  32.38 
 
 		 1219 aa  179  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  29.21 
 
 		 918 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 1209 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  33 
 
 		 1224 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  33.59 
 
 		 1168 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  33.59 
 
 		 1263 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  33.59 
 
 		 1184 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  32.01 
 
 		 1184 aa  156  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.98 
 
 		 535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  27.16 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  27.59 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  25.77 
 
 		 563 aa  124  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  27.42 
 
 		 519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  26.41 
 
 		 525 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  28.33 
 
 		 521 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  28.07 
 
 		 526 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  26.5 
 
 		 521 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  26.93 
 
 		 522 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  29.23 
 
 		 535 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  25.62 
 
 		 522 aa  120  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  29.76 
 
 		 534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  28.31 
 
 		 529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  26.52 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  26.06 
 
 		 519 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  25.52 
 
 		 523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  26.83 
 
 		 521 aa  110  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  25.38 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  30.77 
 
 		 517 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 		 519 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  25.61 
 
 		 534 aa  108  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  27.08 
 
 		 521 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 		 519 aa  107  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  23.11 
 
 		 518 aa  106  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  25.92 
 
 		 524 aa  106  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  25.49 
 
 		 521 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  29.41 
 
 		 613 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  29.56 
 
 		 516 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  26.07 
 
 		 530 aa  106  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  26.75 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  26.75 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  26.75 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  28.83 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  29.96 
 
 		 573 aa  105  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  27.29 
 
 		 541 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  26.42 
 
 		 519 aa  105  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  27.57 
 
 		 513 aa  104  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  30.21 
 
 		 524 aa  104  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  26.5 
 
 		 519 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  26.87 
 
 		 519 aa  103  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  30.09 
 
 		 648 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  27.21 
 
 		 522 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  25.06 
 
 		 523 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  24.86 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  26.11 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  24.81 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  27.72 
 
 		 530 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  23.87 
 
 		 521 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  30.13 
 
 		 541 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  27.97 
 
 		 530 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  26.55 
 
 		 519 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  25.49 
 
 		 519 aa  100  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  24.19 
 
 		 521 aa  99  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  26.67 
 
 		 517 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  28.79 
 
 		 535 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  26.12 
 
 		 518 aa  98.6  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  25.65 
 
 		 516 aa  97.8  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>