More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7324 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  68.33 
 
 		 918 aa  734    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 657 aa  1262    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  46.56 
 
 		 559 aa  383  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  43.5 
 
 		 526 aa  379  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  39.39 
 
 		 534 aa  357  5.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  41.47 
 
 		 621 aa  351  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  39.93 
 
 		 627 aa  349  8e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  40.34 
 
 		 532 aa  330  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  35.45 
 
 		 1217 aa  321  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  44.14 
 
 		 674 aa  319  9e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  37.64 
 
 		 899 aa  319  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  40.58 
 
 		 535 aa  311  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  36.67 
 
 		 568 aa  309  9e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  36.25 
 
 		 552 aa  294  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  38.08 
 
 		 521 aa  277  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  35.13 
 
 		 610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  38.07 
 
 		 533 aa  274  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  36.36 
 
 		 1219 aa  270  5.9999999999999995e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  39.25 
 
 		 570 aa  266  7e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  38.75 
 
 		 592 aa  264  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  36.61 
 
 		 580 aa  262  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  37.12 
 
 		 546 aa  256  8e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  33.4 
 
 		 1219 aa  252  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  35.83 
 
 		 580 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  34.11 
 
 		 1224 aa  234  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  32.96 
 
 		 1209 aa  230  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  32.72 
 
 		 715 aa  226  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  33.68 
 
 		 1184 aa  225  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  38.08 
 
 		 665 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  34.37 
 
 		 560 aa  221  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  34.56 
 
 		 1168 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  34.56 
 
 		 1263 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  34.56 
 
 		 1184 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  31.34 
 
 		 708 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  35.65 
 
 		 517 aa  209  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  31.4 
 
 		 565 aa  205  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  36.34 
 
 		 535 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  32.07 
 
 		 569 aa  196  8.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  34.39 
 
 		 1652 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  30 
 
 		 552 aa  171  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  30.13 
 
 		 563 aa  171  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  30.17 
 
 		 614 aa  170  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  27.66 
 
 		 700 aa  167  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.12 
 
 		 535 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  31.43 
 
 		 530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  27.72 
 
 		 598 aa  162  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  29.69 
 
 		 575 aa  162  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  32.3 
 
 		 579 aa  159  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  28.69 
 
 		 521 aa  158  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  30.55 
 
 		 529 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  28.92 
 
 		 522 aa  154  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  26.93 
 
 		 544 aa  150  6e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  29.49 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  27.5 
 
 		 523 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 		 522 aa  147  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  29.41 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  27.99 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  27.61 
 
 		 534 aa  142  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  29.32 
 
 		 517 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  29.32 
 
 		 517 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  30.17 
 
 		 521 aa  140  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  27.78 
 
 		 522 aa  140  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  27.09 
 
 		 525 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  29.41 
 
 		 526 aa  137  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  28.5 
 
 		 534 aa  137  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  29.06 
 
 		 511 aa  137  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  27.08 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  27.63 
 
 		 526 aa  135  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  28.86 
 
 		 533 aa  134  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  28.22 
 
 		 524 aa  134  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  27.11 
 
 		 511 aa  134  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  30 
 
 		 535 aa  134  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  32.2 
 
 		 538 aa  133  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  26.01 
 
 		 539 aa  133  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  29.44 
 
 		 511 aa  133  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  31.58 
 
 		 541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  29.96 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  31.98 
 
 		 495 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  29.01 
 
 		 545 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  29.41 
 
 		 511 aa  132  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  29.41 
 
 		 511 aa  132  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  26.21 
 
 		 494 aa  132  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  29.41 
 
 		 511 aa  132  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  29.41 
 
 		 511 aa  132  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  29.18 
 
 		 511 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  29.18 
 
 		 511 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  29.18 
 
 		 511 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  29.18 
 
 		 511 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  29.18 
 
 		 511 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  30.34 
 
 		 535 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  28.18 
 
 		 523 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  33.33 
 
 		 648 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  29.25 
 
 		 521 aa  130  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  28.44 
 
 		 573 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  28.11 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  28.78 
 
 		 524 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  28.78 
 
 		 524 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  28.78 
 
 		 524 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  28.78 
 
 		 524 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  28.78 
 
 		 524 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>