More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0027 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 535 aa  989    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  38.9 
 
 		 657 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  37.03 
 
 		 533 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  35.76 
 
 		 532 aa  201  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  33.85 
 
 		 534 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  35.37 
 
 		 559 aa  196  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  35.1 
 
 		 526 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  35.99 
 
 		 674 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  34.57 
 
 		 1217 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  34.44 
 
 		 552 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  32.86 
 
 		 918 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  35.81 
 
 		 535 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  30.87 
 
 		 899 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  32.26 
 
 		 621 aa  169  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  33.5 
 
 		 627 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  30.6 
 
 		 610 aa  162  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  30.43 
 
 		 521 aa  160  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.6 
 
 		 535 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  30.58 
 
 		 568 aa  153  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  32.71 
 
 		 570 aa  153  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  31.87 
 
 		 1219 aa  150  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  36.41 
 
 		 1224 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  30.11 
 
 		 1219 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  31.89 
 
 		 580 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  33.72 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  35.97 
 
 		 1209 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  26.62 
 
 		 563 aa  138  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  27.94 
 
 		 598 aa  134  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  30.28 
 
 		 560 aa  134  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  29.3 
 
 		 565 aa  133  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  33.93 
 
 		 1168 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  31.88 
 
 		 1184 aa  130  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  26.25 
 
 		 544 aa  129  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  33.93 
 
 		 1263 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  33.93 
 
 		 1184 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  28.69 
 
 		 515 aa  126  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  27.79 
 
 		 700 aa  126  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  31.38 
 
 		 708 aa  126  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  32.05 
 
 		 580 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  29.53 
 
 		 665 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  29.12 
 
 		 515 aa  124  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  30.7 
 
 		 552 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  28.82 
 
 		 521 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  28.69 
 
 		 569 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  33.65 
 
 		 538 aa  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  32.49 
 
 		 592 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  25.77 
 
 		 575 aa  120  7e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  27.02 
 
 		 521 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  28.19 
 
 		 546 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  32.83 
 
 		 541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  30.56 
 
 		 715 aa  115  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  27.69 
 
 		 522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  27.67 
 
 		 522 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  27.16 
 
 		 511 aa  114  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  30.5 
 
 		 545 aa  114  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6052  membrane protein putative virulence factor-like protein  29.72 
 
 		 549 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  27.59 
 
 		 511 aa  113  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 		 511 aa  113  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  30.94 
 
 		 648 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  29.34 
 
 		 512 aa  111  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2175  virulence factor MVIN family protein  32.68 
 
 		 527 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134074  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2027  hypothetical protein  33.33 
 
 		 539 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  30.11 
 
 		 573 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  30.75 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  30.75 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  28.97 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  28.38 
 
 		 512 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1346  virulence factor MVIN family protein  31.93 
 
 		 557 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.817252  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  28.87 
 
 		 530 aa  108  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  28.38 
 
 		 512 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  29.07 
 
 		 528 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  28.32 
 
 		 526 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1908  virulence factor MVIN family protein  32.92 
 
 		 567 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146225  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  28.05 
 
 		 518 aa  107  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2444  integral membrane protein MviN  32.69 
 
 		 548 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410377  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  26.03 
 
 		 511 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  25.71 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  25.71 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  25.71 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  25.71 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  25.71 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1776  integral membrane protein MviN  29.97 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  25.38 
 
 		 534 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  29 
 
 		 524 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  27.04 
 
 		 511 aa  104  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  32.82 
 
 		 543 aa  103  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  25.97 
 
 		 511 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  27.56 
 
 		 512 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  28.38 
 
 		 529 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  26.48 
 
 		 511 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  26.48 
 
 		 511 aa  100  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  26.68 
 
 		 512 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  26.48 
 
 		 511 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  26.48 
 
 		 511 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  26.63 
 
 		 511 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  26.48 
 
 		 511 aa  100  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  26.48 
 
 		 511 aa  100  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  26.48 
 
 		 511 aa  100  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  26.48 
 
 		 511 aa  100  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  26.48 
 
 		 511 aa  100  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>