224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7083 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_7083  hypothetical protein  100 
 
 
502 aa  1004    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39640  hypothetical protein  43.33 
 
 
509 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 
1224 aa  226  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  33.13 
 
 
1209 aa  220  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  34.39 
 
 
1168 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  34.39 
 
 
1263 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  34.39 
 
 
1184 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  34.13 
 
 
1184 aa  213  9e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  32.45 
 
 
1219 aa  199  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  31.99 
 
 
1219 aa  189  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  30.58 
 
 
1217 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0037  hypothetical protein  29.7 
 
 
623 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0046  hypothetical protein  29.7 
 
 
623 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0027  hypothetical protein  29.7 
 
 
623 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.476694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6434  serine/threonine protein kinase  25.3 
 
 
477 aa  85.1  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  26.16 
 
 
535 aa  84.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2145  hypothetical protein  25.44 
 
 
473 aa  81.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5083  hypothetical protein  28.37 
 
 
544 aa  73.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3873  serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 
545 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.63 
 
 
601 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  25.35 
 
 
593 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.71 
 
 
647 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.87 
 
 
602 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4576  serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 
556 aa  68.2  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0563383 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.11 
 
 
584 aa  67  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3105  hypothetical protein  24.52 
 
 
505 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.26 
 
 
627 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3575  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
498 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.69 
 
 
613 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.19 
 
 
591 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  22.61 
 
 
692 aa  63.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  24.39 
 
 
625 aa  63.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1908  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.97 
 
 
655 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182347  hitchhiker  0.00089522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 
691 aa  63.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 
666 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.2 
 
 
603 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  23.08 
 
 
656 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2546  hypothetical protein  30.94 
 
 
561 aa  61.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.444477  normal  0.208809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.59 
 
 
664 aa  60.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.61 
 
 
668 aa  60.8  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  23.4 
 
 
662 aa  60.5  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  22.26 
 
 
691 aa  60.5  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7325  serine/threonine protein kinase  27.53 
 
 
730 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416051  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  24.24 
 
 
651 aa  59.3  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.29 
 
 
635 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1760  serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 
399 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.31 
 
 
676 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
776 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  25.19 
 
 
623 aa  57.8  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  23.44 
 
 
612 aa  57.4  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.68 
 
 
614 aa  57.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  21.62 
 
 
657 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25 
 
 
693 aa  57.4  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  21.62 
 
 
657 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  21.62 
 
 
657 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  21.62 
 
 
657 aa  57.4  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  21.62 
 
 
657 aa  57.4  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  21.62 
 
 
657 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  21.62 
 
 
657 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  21.62 
 
 
657 aa  57.4  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  25.46 
 
 
450 aa  57.4  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  21.62 
 
 
657 aa  57.4  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.52 
 
 
681 aa  57.4  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  21.62 
 
 
657 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.12 
 
 
642 aa  57  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3367  hypothetical protein  30.08 
 
 
690 aa  57  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  26.28 
 
 
700 aa  57  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.34 
 
 
696 aa  57  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.15 
 
 
613 aa  56.6  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15820  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 
721 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0718778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0016  serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 
443 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  26.83 
 
 
646 aa  56.6  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0024  protein kinase  31.45 
 
 
443 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0108193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0016  serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 
443 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  26.05 
 
 
609 aa  56.6  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.85 
 
 
653 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5621  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 
845 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205775  normal  0.427226 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4534  serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 
679 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  24.38 
 
 
557 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  27.52 
 
 
573 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  25.34 
 
 
618 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  27.51 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
661 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  26.39 
 
 
543 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.44 
 
 
769 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 
673 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0024  protein kinase  30.82 
 
 
430 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448385  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 
642 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.43 
 
 
641 aa  55.1  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  29.45 
 
 
623 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.63 
 
 
707 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  21.64 
 
 
638 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 
368 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  24.9 
 
 
703 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  24.28 
 
 
615 aa  54.7  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  27.04 
 
 
661 aa  54.7  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0811  protein kinase  30.19 
 
 
436 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.630779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4500  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.23 
 
 
533 aa  54.3  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0420485  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0335  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.76 
 
 
476 aa  54.3  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.83 
 
 
662 aa  54.3  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>