142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2546 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2546  hypothetical protein  100 
 
 
561 aa  1119    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.444477  normal  0.208809 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3367  hypothetical protein  42.06 
 
 
690 aa  147  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  40.72 
 
 
1652 aa  128  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3716  hypothetical protein  43.75 
 
 
596 aa  114  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37930  hypothetical protein  43.17 
 
 
612 aa  107  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31870  hypothetical protein  35.94 
 
 
872 aa  84.3  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4500  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.35 
 
 
533 aa  80.9  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0420485  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3575  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 
498 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9373  hypothetical protein  29.93 
 
 
503 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5083  hypothetical protein  35.06 
 
 
544 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474082  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3105  hypothetical protein  31.54 
 
 
505 aa  71.2  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  32.86 
 
 
1209 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 
595 aa  64.7  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7083  hypothetical protein  27.23 
 
 
502 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4964  putative FHA domain containing protein  27.27 
 
 
532 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4854  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.2 
 
 
546 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  29.29 
 
 
1224 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1760  serine/threonine protein kinase  28.41 
 
 
399 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.86 
 
 
602 aa  60.8  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.01 
 
 
678 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.15 
 
 
662 aa  59.3  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2145  hypothetical protein  28.99 
 
 
473 aa  58.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  26.23 
 
 
535 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26930  hypothetical protein  29.12 
 
 
754 aa  58.9  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  29.47 
 
 
646 aa  58.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 
612 aa  57.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4684  serine/threonine protein kinase  28.11 
 
 
622 aa  57.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.734593  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3873  serine/threonine protein kinase  32.31 
 
 
545 aa  57.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39640  hypothetical protein  29.41 
 
 
509 aa  57.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
982 aa  57.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 
982 aa  57.4  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  28 
 
 
1263 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  28 
 
 
1184 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  28 
 
 
1168 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
985 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 
632 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4576  serine/threonine protein kinase  30.13 
 
 
556 aa  56.2  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0563383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  28.27 
 
 
593 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7325  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
730 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416051  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6434  serine/threonine protein kinase  26.21 
 
 
477 aa  55.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  29.25 
 
 
625 aa  54.7  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 
563 aa  53.9  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  24.15 
 
 
604 aa  53.9  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0860  serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 
502 aa  53.5  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  28.48 
 
 
915 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
569 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.52 
 
 
650 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0943  Serine/threonine protein kinase-like protein  26.64 
 
 
489 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.646835  normal  0.789062 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.5 
 
 
551 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.33 
 
 
591 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 
468 aa  51.2  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0284  serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 
444 aa  50.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5881  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
264 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00553777  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4064  protein kinase  27.72 
 
 
863 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.731546  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 
468 aa  50.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  27.54 
 
 
1184 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  31.03 
 
 
1219 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0600  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 
510 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0109114  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2528  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 
266 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00115723  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  29.51 
 
 
1219 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3125  protein kinase  26.51 
 
 
466 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3947  serine/threonine protein kinase  25.44 
 
 
602 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0694263  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3927  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  25.59 
 
 
544 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  24.88 
 
 
638 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0171  serine/threonine protein kinase  24.19 
 
 
575 aa  49.3  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.495174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5401  protein kinase  32.99 
 
 
406 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.221453  normal  0.223207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1671  protein kinase  39.73 
 
 
301 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  27.05 
 
 
888 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 
790 aa  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  26.46 
 
 
1217 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4534  serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 
679 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  29.37 
 
 
478 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.42 
 
 
598 aa  47.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  24.02 
 
 
666 aa  47.4  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  24.49 
 
 
659 aa  47.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  25.87 
 
 
621 aa  47.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  24.32 
 
 
425 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  26.03 
 
 
446 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  21.63 
 
 
692 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  22.64 
 
 
623 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
581 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  25.36 
 
 
621 aa  47  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  23.15 
 
 
990 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  26.32 
 
 
586 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1541  hypothetical protein  27.08 
 
 
443 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907452  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.68 
 
 
642 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28 
 
 
728 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.28 
 
 
668 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00190  serine/threonine protein kinase  25.4 
 
 
663 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0540  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 
759 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.623105  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  21.63 
 
 
691 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0552  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 
759 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.274809  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68332  carbon catabolite derepressing ser/thr protein kinase  25.71 
 
 
580 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.721612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0530  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 
759 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1389  protein kinase  27.84 
 
 
412 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00892717  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0019  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 
556 aa  46.2  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24 
 
 
579 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5606  serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 
483 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  22.27 
 
 
625 aa  45.4  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  23.97 
 
 
675 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>