32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31870 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_31870  hypothetical protein  100 
 
 
872 aa  1672    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2546  hypothetical protein  35.94 
 
 
561 aa  84.7  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.444477  normal  0.208809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3716  hypothetical protein  38.69 
 
 
596 aa  84  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5083  hypothetical protein  33.04 
 
 
544 aa  82.4  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26930  hypothetical protein  33.93 
 
 
754 aa  80.5  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  36.7 
 
 
1652 aa  79.7  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3367  hypothetical protein  29.44 
 
 
690 aa  77.8  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4160  hypothetical protein  29 
 
 
539 aa  70.5  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.819524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7325  serine/threonine protein kinase  37.3 
 
 
730 aa  67.8  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416051  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3927  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  30.87 
 
 
544 aa  67.4  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37930  hypothetical protein  36.51 
 
 
612 aa  66.6  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4500  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.83 
 
 
533 aa  66.6  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0420485  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9373  hypothetical protein  29.66 
 
 
503 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4534  serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 
679 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3575  serine/threonine protein kinase  31.93 
 
 
498 aa  56.6  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3105  hypothetical protein  29.1 
 
 
505 aa  56.6  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4684  serine/threonine protein kinase  33.99 
 
 
622 aa  55.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.734593  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7083  hypothetical protein  28.89 
 
 
502 aa  52  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 
646 aa  50.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0027  hypothetical protein  28 
 
 
623 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.476694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0037  hypothetical protein  28.4 
 
 
623 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0046  hypothetical protein  28.4 
 
 
623 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  28.14 
 
 
1184 aa  48.1  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 
535 aa  47.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  28.45 
 
 
1219 aa  46.6  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2145  hypothetical protein  27.86 
 
 
473 aa  47  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  26.56 
 
 
666 aa  46.2  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  29.82 
 
 
1209 aa  45.8  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
569 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  24.04 
 
 
593 aa  45.8  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4854  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.08 
 
 
546 aa  44.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  29.2 
 
 
1217 aa  44.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>