133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37930 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_37930  hypothetical protein  100 
 
 
612 aa  1175    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2546  hypothetical protein  31.19 
 
 
561 aa  201  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.444477  normal  0.208809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3716  hypothetical protein  51.59 
 
 
596 aa  186  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638349 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  42.8 
 
 
1652 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4500  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.64 
 
 
533 aa  117  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0420485  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3367  hypothetical protein  37.1 
 
 
690 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26930  hypothetical protein  36.45 
 
 
754 aa  89  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7325  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 
730 aa  85.5  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416051  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4576  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 
556 aa  83.6  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0563383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  32 
 
 
535 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4854  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 
546 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3575  serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 
498 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4684  serine/threonine protein kinase  34.44 
 
 
622 aa  76.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.734593  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3105  hypothetical protein  35.42 
 
 
505 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31870  hypothetical protein  28.02 
 
 
872 aa  74.7  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  34.51 
 
 
1217 aa  74.7  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9373  hypothetical protein  31.93 
 
 
503 aa  67  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  32.21 
 
 
481 aa  64.3  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27020  protein kinase family protein  26.62 
 
 
578 aa  62  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6434  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
477 aa  60.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 
562 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5083  hypothetical protein  27.43 
 
 
544 aa  60.1  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474082  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4534  serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 
679 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  34.59 
 
 
1209 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
535 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4964  putative FHA domain containing protein  33.07 
 
 
532 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  33.55 
 
 
563 aa  58.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 
468 aa  58.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6663  serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 
414 aa  57.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.997468  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.12 
 
 
614 aa  57.4  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 
525 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.73 
 
 
499 aa  57.4  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 
445 aa  56.6  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  32.23 
 
 
1224 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0055  hypothetical protein  22.93 
 
 
739 aa  55.8  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39640  hypothetical protein  30.89 
 
 
509 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 
605 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2336  protein kinase  27.64 
 
 
684 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  29.52 
 
 
621 aa  54.7  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  33.14 
 
 
674 aa  54.3  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  25.26 
 
 
692 aa  54.3  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  24.02 
 
 
691 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  31.15 
 
 
721 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  28.5 
 
 
501 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3065  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 
499 aa  53.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.648627  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  26.36 
 
 
612 aa  52.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  30.12 
 
 
377 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  29.87 
 
 
596 aa  52.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.7 
 
 
650 aa  52.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 
666 aa  52.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0021  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 
610 aa  52  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.5 
 
 
645 aa  52.4  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 
391 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  29.39 
 
 
425 aa  51.6  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2937  protein kinase  31.68 
 
 
414 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0760127  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.1 
 
 
627 aa  51.6  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5395  serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
403 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5484  serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
403 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403058  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5771  serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
405 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5401  protein kinase  29.76 
 
 
406 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.221453  normal  0.223207 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  31.55 
 
 
461 aa  50.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0021  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
581 aa  50.8  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813832 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00370  serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 
419 aa  50.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.339035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 
646 aa  50.4  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.5 
 
 
520 aa  50.4  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 
568 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  33.77 
 
 
482 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  29.17 
 
 
658 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  33.14 
 
 
617 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 
599 aa  49.7  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 
674 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2907  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 
414 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2951  protein kinase  31.06 
 
 
414 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426406  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0026  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 
444 aa  49.7  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  28.31 
 
 
593 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1445  hypothetical protein  32.24 
 
 
687 aa  49.3  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.246982  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3927  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  29 
 
 
544 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 
465 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2528  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 
266 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00115723  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
624 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  30.52 
 
 
710 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
624 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  27.24 
 
 
403 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
624 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
595 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  23.28 
 
 
625 aa  48.9  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 
419 aa  48.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5247  serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 
498 aa  48.5  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592329 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1309  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.03 
 
 
517 aa  48.5  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  33.33 
 
 
1837 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2290  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 
560 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.770072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9039  serine/threonine protein kinase  27.01 
 
 
594 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 
569 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  30.91 
 
 
567 aa  47.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0362  serine/threonine protein kinase  24.3 
 
 
632 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  32.24 
 
 
559 aa  47.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.08 
 
 
584 aa  47.4  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1433  protein kinase  27.93 
 
 
963 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698997  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.53 
 
 
1655 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03420  protein kinase family protein  27.04 
 
 
587 aa  47  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.416082 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>