More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0635 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
721 aa  1442    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32540  protein kinase family protein  68.98 
 
 
583 aa  351  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.412374  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  40.3 
 
 
509 aa  189  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  43.13 
 
 
562 aa  189  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
559 aa  189  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  40.26 
 
 
695 aa  187  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  40.42 
 
 
554 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  41.49 
 
 
1029 aa  180  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  37.74 
 
 
855 aa  178  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  40.48 
 
 
571 aa  178  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  44.66 
 
 
535 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 
466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  39.13 
 
 
575 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  41.54 
 
 
659 aa  174  7.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  41.7 
 
 
563 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  43.53 
 
 
528 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
385 aa  171  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  36.03 
 
 
612 aa  170  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  41.73 
 
 
553 aa  170  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  40 
 
 
675 aa  169  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.87 
 
 
596 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 
646 aa  167  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.29 
 
 
551 aa  167  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  39.77 
 
 
411 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  43.12 
 
 
468 aa  167  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  43.05 
 
 
422 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  40.77 
 
 
460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 
776 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.59 
 
 
405 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 
581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  42.44 
 
 
766 aa  165  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.08 
 
 
591 aa  165  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 
605 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  42.08 
 
 
482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  41.22 
 
 
673 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  41.43 
 
 
674 aa  164  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  41.13 
 
 
525 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  39.62 
 
 
593 aa  164  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
493 aa  164  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  39.6 
 
 
461 aa  163  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  40.35 
 
 
583 aa  163  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  39.8 
 
 
621 aa  161  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  39 
 
 
501 aa  160  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  44.06 
 
 
525 aa  160  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  40.48 
 
 
419 aa  160  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.91 
 
 
531 aa  160  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.23 
 
 
602 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
493 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
666 aa  159  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  39.09 
 
 
673 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  39.55 
 
 
776 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.99 
 
 
512 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.61 
 
 
521 aa  158  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.07 
 
 
579 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
703 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.81 
 
 
505 aa  157  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.2 
 
 
598 aa  157  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  42.72 
 
 
581 aa  157  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  39.37 
 
 
631 aa  156  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 
419 aa  156  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  41.79 
 
 
617 aa  156  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  42.24 
 
 
503 aa  156  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  37.3 
 
 
487 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  40.62 
 
 
596 aa  155  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
418 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  39.7 
 
 
705 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.62 
 
 
678 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  34.86 
 
 
666 aa  154  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  36.68 
 
 
638 aa  154  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  42.65 
 
 
632 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.73 
 
 
584 aa  153  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 
575 aa  152  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3705  protein kinase  39.69 
 
 
449 aa  152  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424517  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0235  protein kinase  41.1 
 
 
352 aa  151  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.692705 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  38.21 
 
 
651 aa  150  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.13 
 
 
652 aa  150  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  40.72 
 
 
502 aa  150  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  40.29 
 
 
621 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  40.8 
 
 
571 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  40.1 
 
 
642 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5247  serine/threonine protein kinase  39.03 
 
 
498 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592329 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3065  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  38.55 
 
 
499 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.648627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.84 
 
 
446 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  36.03 
 
 
468 aa  148  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  38.02 
 
 
595 aa  148  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5859  serine/threonine protein kinase  43.2 
 
 
513 aa  148  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  36 
 
 
528 aa  148  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  37.5 
 
 
604 aa  148  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  40.3 
 
 
599 aa  148  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  38.21 
 
 
623 aa  148  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.74 
 
 
650 aa  148  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  37.94 
 
 
450 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  38.01 
 
 
464 aa  147  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  33.74 
 
 
825 aa  147  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03850  protein kinase family protein  39.06 
 
 
651 aa  147  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  40.1 
 
 
465 aa  147  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.86 
 
 
642 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  30.69 
 
 
664 aa  147  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  30.69 
 
 
664 aa  147  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 
480 aa  147  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>