More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6520 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
466 aa  921    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  69.04 
 
 
575 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  65.45 
 
 
553 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  59.48 
 
 
509 aa  331  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  63.41 
 
 
559 aa  322  6e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  59.71 
 
 
554 aa  317  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  55.94 
 
 
571 aa  297  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  54.35 
 
 
855 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  55.72 
 
 
405 aa  279  9e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  53.62 
 
 
493 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  43.09 
 
 
385 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  48.16 
 
 
528 aa  236  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.69 
 
 
596 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  45.15 
 
 
776 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  46.32 
 
 
632 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  47.45 
 
 
411 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.15 
 
 
678 aa  223  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  43.91 
 
 
674 aa  217  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  42.32 
 
 
675 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  43.68 
 
 
525 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  43.75 
 
 
525 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  41.86 
 
 
703 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  44.7 
 
 
562 aa  213  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  41.98 
 
 
659 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  44.49 
 
 
605 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  43.87 
 
 
422 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.57 
 
 
521 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  46.27 
 
 
482 aa  207  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  38.74 
 
 
563 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.82 
 
 
659 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  43.61 
 
 
487 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.87 
 
 
531 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 
695 aa  203  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  44.19 
 
 
419 aa  202  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  40.71 
 
 
766 aa  202  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  44.65 
 
 
617 aa  202  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  42.05 
 
 
501 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  43.98 
 
 
673 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  44.36 
 
 
470 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  48.57 
 
 
535 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  43.82 
 
 
705 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 
419 aa  199  9e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  43.61 
 
 
631 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  44.16 
 
 
595 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.42 
 
 
668 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  44.07 
 
 
596 aa  196  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  45.63 
 
 
503 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  41.33 
 
 
507 aa  196  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  46.12 
 
 
575 aa  193  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  43.18 
 
 
1029 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  45.74 
 
 
493 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  46.67 
 
 
660 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  39.08 
 
 
316 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  40.86 
 
 
377 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  36.12 
 
 
468 aa  190  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 
721 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  38.81 
 
 
418 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  37.55 
 
 
320 aa  187  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  44.4 
 
 
476 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.8 
 
 
532 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  42.69 
 
 
461 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.51 
 
 
446 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  42.69 
 
 
468 aa  186  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  38.49 
 
 
666 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
674 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  39.93 
 
 
646 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3065  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  34.53 
 
 
499 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.648627  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  37.45 
 
 
651 aa  182  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  40.58 
 
 
581 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.19 
 
 
667 aa  181  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  35.76 
 
 
692 aa  180  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0026  serine/threonine protein kinase  41.11 
 
 
444 aa  180  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  39.85 
 
 
673 aa  179  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 
460 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 
564 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  45.13 
 
 
1655 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  44.78 
 
 
532 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  44.24 
 
 
345 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.45 
 
 
627 aa  178  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.78 
 
 
652 aa  178  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
776 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  44.1 
 
 
534 aa  177  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04830  serine/threonine protein kinase  39.34 
 
 
316 aa  177  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0435462  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.33 
 
 
505 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  38.69 
 
 
612 aa  176  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00190  serine/threonine protein kinase  40.08 
 
 
663 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0021  serine/threonine protein kinase  38.43 
 
 
581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  37.59 
 
 
543 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  39.64 
 
 
583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  36.29 
 
 
692 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  35.91 
 
 
691 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  28.5 
 
 
664 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  28.5 
 
 
664 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  39.93 
 
 
382 aa  173  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.98 
 
 
658 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  40.6 
 
 
503 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  40.19 
 
 
625 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  35.63 
 
 
469 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0021  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
610 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.68 
 
 
627 aa  170  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>