More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04830 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_04830  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
316 aa  625  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0435462  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
559 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  39.86 
 
 
575 aa  185  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  40.55 
 
 
553 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  39.34 
 
 
466 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  35.45 
 
 
509 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
571 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  38.43 
 
 
385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  37.45 
 
 
554 aa  165  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  38.58 
 
 
855 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  37.92 
 
 
776 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.27 
 
 
405 aa  155  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.37 
 
 
668 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  35.69 
 
 
493 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
562 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  37.38 
 
 
638 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  36.92 
 
 
535 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.09 
 
 
678 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  39 
 
 
468 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  33.43 
 
 
563 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  37.85 
 
 
468 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  36.76 
 
 
419 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  37.1 
 
 
659 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.38 
 
 
596 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  37 
 
 
621 aa  142  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
528 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  36.06 
 
 
419 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
605 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  37.14 
 
 
503 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
422 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  35.62 
 
 
525 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  42.92 
 
 
674 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  35.79 
 
 
695 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  35.41 
 
 
675 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
673 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.91 
 
 
446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  39.1 
 
 
1029 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.23 
 
 
521 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  33.98 
 
 
377 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 
418 aa  135  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  34.54 
 
 
632 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  34.93 
 
 
766 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  35.84 
 
 
345 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 
525 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  37.38 
 
 
617 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 
391 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.49 
 
 
627 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.89 
 
 
532 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 
411 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  36.9 
 
 
470 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  32.49 
 
 
595 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  36.82 
 
 
482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
461 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  33.07 
 
 
674 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  36.99 
 
 
481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.91 
 
 
657 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  28.96 
 
 
501 aa  125  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  36.45 
 
 
703 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  36 
 
 
659 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  35.27 
 
 
534 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  36.19 
 
 
493 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  34.4 
 
 
705 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  34.27 
 
 
320 aa  123  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.45 
 
 
632 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.32 
 
 
551 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5881  serine/threonine protein kinase  34.16 
 
 
264 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00553777  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  32.13 
 
 
638 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 
460 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  36.49 
 
 
646 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  34.27 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 
631 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 
703 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  30 
 
 
656 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 
507 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 
657 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 
657 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 
657 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 
657 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.23 
 
 
531 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.28 
 
 
627 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  35.94 
 
 
543 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 
657 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.02 
 
 
653 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 
657 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  36.06 
 
 
642 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 
657 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 
657 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 
657 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  34.33 
 
 
790 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  32.23 
 
 
614 aa  117  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  35.04 
 
 
501 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 
721 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  32.73 
 
 
692 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  29.78 
 
 
596 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.96 
 
 
668 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 
465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.7 
 
 
650 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  27.91 
 
 
666 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  32.27 
 
 
691 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>