More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2069 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
501 aa  952    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  63.81 
 
 
534 aa  316  7e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  54.47 
 
 
703 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  51.41 
 
 
631 aa  243  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  50.74 
 
 
705 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  46.94 
 
 
525 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  46.58 
 
 
468 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  49.09 
 
 
528 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.13 
 
 
678 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  45.78 
 
 
632 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.33 
 
 
446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  45.4 
 
 
766 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.18 
 
 
659 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  47.2 
 
 
776 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  46.82 
 
 
564 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  45.59 
 
 
422 aa  203  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  43.82 
 
 
419 aa  202  9e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  44.94 
 
 
605 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  41.42 
 
 
543 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  43.26 
 
 
501 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  47.41 
 
 
525 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.38 
 
 
521 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  41.64 
 
 
418 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  44.32 
 
 
487 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.34 
 
 
668 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.67 
 
 
531 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.02 
 
 
596 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  44.68 
 
 
460 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  44.22 
 
 
503 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  43.56 
 
 
411 aa  189  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  38.15 
 
 
562 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  44.32 
 
 
468 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  42.59 
 
 
674 aa  186  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  44.81 
 
 
659 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  46.24 
 
 
461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  43.43 
 
 
675 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  46.77 
 
 
660 aa  184  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  45.39 
 
 
621 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  44.85 
 
 
470 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  42.91 
 
 
493 aa  180  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  40.95 
 
 
377 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3106  serine/threonine protein kinase  47.43 
 
 
538 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  45.39 
 
 
638 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  43.49 
 
 
532 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  43.6 
 
 
595 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  40.2 
 
 
535 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  48.15 
 
 
553 aa  174  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  46.01 
 
 
575 aa  172  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  47.23 
 
 
556 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  40.51 
 
 
345 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  41.16 
 
 
575 aa  171  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.05 
 
 
532 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  38.55 
 
 
563 aa  167  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  48.91 
 
 
674 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  42.91 
 
 
650 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  43.73 
 
 
419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  40.07 
 
 
507 aa  163  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  44.4 
 
 
554 aa  161  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  38.68 
 
 
695 aa  160  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  37.97 
 
 
296 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  44.2 
 
 
855 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  42.86 
 
 
509 aa  160  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  44.86 
 
 
493 aa  159  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  41.28 
 
 
466 aa  157  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  39.31 
 
 
559 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  36.31 
 
 
481 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  47.6 
 
 
617 aa  153  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  41.22 
 
 
385 aa  152  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.13 
 
 
512 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  41.42 
 
 
476 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  41.13 
 
 
581 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  42.59 
 
 
482 aa  150  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  41.39 
 
 
391 aa  150  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  38.64 
 
 
612 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  40.17 
 
 
571 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  36.83 
 
 
658 aa  146  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  40.31 
 
 
962 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
1029 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.41 
 
 
641 aa  144  5e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1248  serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 
543 aa  143  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.987546  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  34.92 
 
 
457 aa  143  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  38.29 
 
 
673 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.43 
 
 
579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  38.26 
 
 
623 aa  140  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  37.09 
 
 
368 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  27.16 
 
 
623 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5881  serine/threonine protein kinase  40.74 
 
 
264 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00553777  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.34 
 
 
591 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  33.89 
 
 
503 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  35.52 
 
 
425 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  33.05 
 
 
692 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  37.29 
 
 
646 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  32.27 
 
 
662 aa  137  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  37.34 
 
 
593 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  37.97 
 
 
596 aa  137  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  38.71 
 
 
651 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.72 
 
 
696 aa  137  6.0000000000000005e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.15 
 
 
842 aa  136  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
691 aa  136  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>