More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0406 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
418 aa  821    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  67 
 
 
419 aa  511  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  57.63 
 
 
528 aa  285  8e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  56.55 
 
 
422 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  50.99 
 
 
461 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  52.47 
 
 
632 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.92 
 
 
678 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  55.47 
 
 
668 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  54.07 
 
 
468 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  50.74 
 
 
776 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  51.34 
 
 
525 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.55 
 
 
596 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  50.18 
 
 
766 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  52.42 
 
 
377 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  50.55 
 
 
487 aa  256  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  49.81 
 
 
675 aa  256  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  49.81 
 
 
659 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.04 
 
 
531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  47.96 
 
 
501 aa  242  7.999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  49.25 
 
 
705 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.43 
 
 
659 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  50 
 
 
621 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  48.13 
 
 
631 aa  237  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  47.35 
 
 
525 aa  236  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  48.34 
 
 
470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  45.85 
 
 
563 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  49.24 
 
 
638 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  47.08 
 
 
460 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  52.21 
 
 
575 aa  229  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.49 
 
 
521 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  49.13 
 
 
595 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  44.27 
 
 
674 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  37.81 
 
 
562 aa  227  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  46.74 
 
 
345 aa  227  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.06 
 
 
532 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  45.82 
 
 
703 aa  222  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  45.72 
 
 
564 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  44.27 
 
 
535 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  45.09 
 
 
493 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.53 
 
 
446 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  46.91 
 
 
695 aa  216  5e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  47.27 
 
 
503 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  45.19 
 
 
534 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  53.85 
 
 
507 aa  213  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  51.18 
 
 
674 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  42.27 
 
 
571 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  44.53 
 
 
855 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  41.3 
 
 
575 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  45.59 
 
 
296 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  48.69 
 
 
476 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  46.64 
 
 
673 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  41.03 
 
 
605 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  46.13 
 
 
1029 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  42.97 
 
 
553 aa  200  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  45.35 
 
 
468 aa  200  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  45.72 
 
 
532 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5881  serine/threonine protein kinase  46.74 
 
 
264 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00553777  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  42.47 
 
 
554 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  41.64 
 
 
501 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  41.51 
 
 
559 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  45.58 
 
 
650 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  45.77 
 
 
419 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  50.24 
 
 
617 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 
385 aa  190  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  45.81 
 
 
581 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  39.7 
 
 
509 aa  187  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  41.76 
 
 
391 aa  186  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  38.87 
 
 
543 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  42.38 
 
 
493 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  42.18 
 
 
612 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  41.89 
 
 
481 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
556 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  40.37 
 
 
583 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.3 
 
 
405 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  38.49 
 
 
621 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  38.81 
 
 
466 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  37.31 
 
 
612 aa  177  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  40.55 
 
 
660 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.19 
 
 
512 aa  176  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3106  serine/threonine protein kinase  44.28 
 
 
538 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  41.29 
 
 
482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  36.61 
 
 
623 aa  171  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  37.56 
 
 
651 aa  171  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  39.3 
 
 
646 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  32.57 
 
 
638 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1248  serine/threonine protein kinase  39.34 
 
 
543 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.987546  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  37.16 
 
 
457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.93 
 
 
652 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.08 
 
 
642 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  38.68 
 
 
692 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  38.21 
 
 
691 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 
425 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  36.52 
 
 
703 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.74 
 
 
662 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.05 
 
 
653 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  36.79 
 
 
662 aa  163  6e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.38 
 
 
650 aa  162  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  37.06 
 
 
666 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.15 
 
 
579 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>