More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25260 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  100 
 
 
501 aa  1028    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  49.9 
 
 
487 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  45.82 
 
 
493 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  59.32 
 
 
476 aa  283  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  49.06 
 
 
468 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  51.98 
 
 
525 aa  249  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  51.3 
 
 
411 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.35 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  46.34 
 
 
418 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  50.76 
 
 
528 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  47.58 
 
 
422 aa  240  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.64 
 
 
596 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  47.4 
 
 
632 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.53 
 
 
531 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.79 
 
 
678 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  48.91 
 
 
674 aa  236  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  45.35 
 
 
776 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  52.21 
 
 
659 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  44.48 
 
 
631 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  45.93 
 
 
766 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  44.23 
 
 
675 aa  227  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  44.62 
 
 
659 aa  226  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  39.3 
 
 
563 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.4 
 
 
521 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  46.95 
 
 
674 aa  221  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.33 
 
 
668 aa  220  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  43.8 
 
 
535 aa  219  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  48.39 
 
 
345 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 
617 aa  217  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  47.04 
 
 
534 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  46.18 
 
 
705 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  41.16 
 
 
695 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  45.88 
 
 
461 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 
468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  45.72 
 
 
503 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  47.17 
 
 
621 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  47.17 
 
 
638 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
703 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  47.41 
 
 
1029 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  41.57 
 
 
562 aa  209  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  49.1 
 
 
507 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
564 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  45.42 
 
 
605 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  44.03 
 
 
855 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  41.21 
 
 
595 aa  207  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  49 
 
 
575 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  46.21 
 
 
377 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  43.8 
 
 
460 aa  203  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  42.05 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  44.85 
 
 
470 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.52 
 
 
446 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  42.07 
 
 
575 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  43.6 
 
 
583 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  41.25 
 
 
501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  45.59 
 
 
673 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  43.3 
 
 
571 aa  196  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  41.64 
 
 
554 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  44.09 
 
 
553 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  45.91 
 
 
650 aa  193  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 
559 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.45 
 
 
512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  46.75 
 
 
581 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  43.87 
 
 
482 aa  190  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.55 
 
 
532 aa  190  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  41.42 
 
 
466 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  44.07 
 
 
419 aa  186  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  43.8 
 
 
391 aa  186  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  43.01 
 
 
493 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  44.36 
 
 
532 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  38.81 
 
 
509 aa  183  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5881  serine/threonine protein kinase  40.93 
 
 
264 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00553777  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  40.07 
 
 
517 aa  180  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  41.9 
 
 
596 aa  179  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  41.79 
 
 
543 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  36.1 
 
 
621 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.58 
 
 
579 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  43.13 
 
 
658 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  42.54 
 
 
556 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  41.88 
 
 
825 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  36.61 
 
 
612 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  37.54 
 
 
385 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  40.94 
 
 
468 aa  171  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0235  protein kinase  42.19 
 
 
352 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.692705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.51 
 
 
757 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  35.41 
 
 
660 aa  170  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  41.53 
 
 
668 aa  170  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  38.64 
 
 
481 aa  169  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  35.48 
 
 
593 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 
651 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.38 
 
 
627 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  34.63 
 
 
638 aa  167  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1248  serine/threonine protein kinase  41.54 
 
 
543 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.987546  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  37.76 
 
 
634 aa  167  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  38.64 
 
 
662 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.91 
 
 
591 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  36.96 
 
 
692 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.89 
 
 
647 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  36.58 
 
 
691 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3106  serine/threonine protein kinase  47.91 
 
 
538 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  39.26 
 
 
559 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>