More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4028 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
493 aa  997    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  45.82 
 
 
501 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  46.44 
 
 
487 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  59.39 
 
 
525 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  51.58 
 
 
476 aa  256  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  48.49 
 
 
411 aa  249  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.27 
 
 
596 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.69 
 
 
531 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.83 
 
 
678 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  43.41 
 
 
422 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  48.52 
 
 
528 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  44.01 
 
 
659 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  45.72 
 
 
525 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  48.28 
 
 
632 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  44.49 
 
 
675 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  45.91 
 
 
419 aa  234  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  47.01 
 
 
468 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  44.6 
 
 
766 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  42.12 
 
 
562 aa  231  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.8 
 
 
521 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  45.21 
 
 
776 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  45.09 
 
 
418 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  47.37 
 
 
564 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  40.84 
 
 
563 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  46.62 
 
 
470 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  47.77 
 
 
503 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.47 
 
 
659 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  47.01 
 
 
534 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  45.23 
 
 
595 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  45.55 
 
 
345 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  41.54 
 
 
535 aa  217  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  47.6 
 
 
575 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  46.92 
 
 
507 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.3 
 
 
668 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  44.15 
 
 
674 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  45.63 
 
 
631 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
674 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  44.87 
 
 
705 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  43.32 
 
 
621 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  45.6 
 
 
703 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  46.94 
 
 
695 aa  206  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.98 
 
 
446 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 
605 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  46.61 
 
 
1029 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  42.21 
 
 
638 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  43.92 
 
 
461 aa  200  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  44.31 
 
 
460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  43.45 
 
 
296 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  46.25 
 
 
391 aa  197  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  42.76 
 
 
377 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  49.78 
 
 
617 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  44.24 
 
 
468 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.01 
 
 
512 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  46.42 
 
 
532 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  41.29 
 
 
575 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  42.91 
 
 
501 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.43 
 
 
532 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  46.12 
 
 
581 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  42.12 
 
 
554 aa  187  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  40.94 
 
 
855 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 
583 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  41.11 
 
 
419 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  42.98 
 
 
650 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  42.28 
 
 
482 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  42.15 
 
 
481 aa  183  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  40.52 
 
 
509 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  40.59 
 
 
466 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
673 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  39.36 
 
 
571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  38.77 
 
 
593 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1248  serine/threonine protein kinase  40.6 
 
 
543 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.987546  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 
559 aa  177  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3705  protein kinase  44.57 
 
 
449 aa  176  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  39.16 
 
 
621 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  37.4 
 
 
634 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.38 
 
 
591 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  40.94 
 
 
553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  39.56 
 
 
543 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  37.13 
 
 
503 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5881  serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 
264 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00553777  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  36.72 
 
 
662 aa  172  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  40.86 
 
 
556 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  40.26 
 
 
465 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  40.95 
 
 
825 aa  170  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  38.63 
 
 
596 aa  169  8e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  34.04 
 
 
604 aa  168  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  35.47 
 
 
692 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  36.55 
 
 
763 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  37.3 
 
 
468 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2062  serine/threonine protein kinase  39.31 
 
 
617 aa  167  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.48 
 
 
579 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  36.81 
 
 
721 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10015  transmembrane serine/threonine-protein kinase A pknA  41.82 
 
 
431 aa  166  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 
691 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.04 
 
 
627 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0016  serine/threonine protein kinase  42.73 
 
 
443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283317  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  37.25 
 
 
641 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0024  protein kinase  42.73 
 
 
443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0108193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0016  serine/threonine protein kinase  42.73 
 
 
443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  40.14 
 
 
493 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>