More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4477 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
581 aa  1155    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  42.62 
 
 
583 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  51.46 
 
 
528 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  51.15 
 
 
468 aa  243  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.96 
 
 
596 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  47.85 
 
 
411 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  48.85 
 
 
525 aa  227  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  46.1 
 
 
674 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  46.42 
 
 
766 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  50 
 
 
521 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  47.94 
 
 
776 aa  220  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  43.35 
 
 
632 aa  219  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  45.3 
 
 
487 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  47.1 
 
 
563 aa  210  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.1 
 
 
678 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.24 
 
 
562 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  45.93 
 
 
659 aa  206  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.02 
 
 
532 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  46.55 
 
 
470 aa  204  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  48.71 
 
 
650 aa  204  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.28 
 
 
668 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  44.81 
 
 
675 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  51.88 
 
 
621 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  35.7 
 
 
559 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  44.28 
 
 
419 aa  196  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  44.81 
 
 
535 aa  196  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  51.7 
 
 
638 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  43.17 
 
 
525 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
703 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  42.86 
 
 
501 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  40.61 
 
 
418 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  47.89 
 
 
503 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  44.2 
 
 
422 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.33 
 
 
531 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  49.62 
 
 
673 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  41.96 
 
 
855 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.44 
 
 
512 aa  190  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  45.15 
 
 
461 aa  189  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  44.83 
 
 
556 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  45.32 
 
 
460 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  50.68 
 
 
377 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  41.53 
 
 
493 aa  187  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  45.39 
 
 
631 aa  187  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  47.43 
 
 
674 aa  186  9e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  39.86 
 
 
575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  41.87 
 
 
554 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.57 
 
 
446 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  42.61 
 
 
468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  38.14 
 
 
595 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  47.06 
 
 
532 aa  183  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  45.04 
 
 
660 aa  183  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  41.92 
 
 
571 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.85 
 
 
659 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  45.22 
 
 
705 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  43.59 
 
 
534 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  48 
 
 
507 aa  180  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  48.85 
 
 
575 aa  177  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  40.36 
 
 
509 aa  177  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  41.13 
 
 
543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 
695 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  42.91 
 
 
391 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  43.68 
 
 
476 aa  173  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  40.93 
 
 
1032 aa  173  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 
721 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  39.09 
 
 
617 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
296 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  40.93 
 
 
1032 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  42 
 
 
623 aa  170  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  37.25 
 
 
466 aa  169  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  43.41 
 
 
1029 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  41.47 
 
 
605 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  42.02 
 
 
564 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  33 
 
 
641 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.52 
 
 
614 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 
345 aa  163  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1248  serine/threonine protein kinase  37.78 
 
 
543 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.987546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3106  serine/threonine protein kinase  42.71 
 
 
538 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.7 
 
 
405 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  38.64 
 
 
1018 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  33.42 
 
 
503 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  43.53 
 
 
484 aa  160  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
596 aa  160  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  40.68 
 
 
497 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.04 
 
 
584 aa  159  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1066  protein kinase  45.73 
 
 
486 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.07 
 
 
681 aa  159  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.27 
 
 
700 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5881  serine/threonine protein kinase  39.7 
 
 
264 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00553777  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.17 
 
 
518 aa  158  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  35.88 
 
 
612 aa  157  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  34 
 
 
632 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  41.25 
 
 
517 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  37.12 
 
 
746 aa  156  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0860  serine/threonine protein kinase  39.51 
 
 
502 aa  156  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  38.24 
 
 
673 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  38.95 
 
 
636 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  38.69 
 
 
501 aa  156  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  38.8 
 
 
385 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.79 
 
 
757 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  37.21 
 
 
625 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>