More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0682 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 674 aa  1291    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  88.92 
 
 		 617 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  56.11 
 
 		 695 aa  285  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  52.96 
 
 		 632 aa  265  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  50.3 
 
 		 673 aa  263  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  51.61 
 
 		 1029 aa  260  7e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  50.55 
 
 		 525 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  50.91 
 
 		 563 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  52.92 
 
 		 776 aa  249  8e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  52.65 
 
 		 501 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  45.33 
 
 		 562 aa  244  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  56.5 
 
 		 528 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  52.05 
 
 		 468 aa  240  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  50.96 
 
 		 411 aa  239  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.63 
 
 		 596 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  52.87 
 
 		 422 aa  238  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  49.39 
 
 		 487 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.89 
 
 		 521 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  51.52 
 
 		 419 aa  232  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  48.64 
 
 		 659 aa  229  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  49.6 
 
 		 766 aa  229  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  45.56 
 
 		 525 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  52.02 
 
 		 531 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  47.88 
 
 		 675 aa  226  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.4 
 
 		 668 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  51.18 
 
 		 418 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  52.7 
 
 		 703 aa  224  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  52.91 
 
 		 461 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  49.56 
 
 		 535 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  49.78 
 
 		 493 aa  223  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  51.37 
 
 		 575 aa  220  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  43.43 
 
 		 605 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  53.4 
 
 		 377 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  49.24 
 
 		 460 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  44.65 
 
 		 571 aa  217  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.61 
 
 		 659 aa  216  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  45.49 
 
 		 554 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  48.5 
 
 		 621 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  48.81 
 
 		 705 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  49.61 
 
 		 470 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  45.74 
 
 		 674 aa  213  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  49.05 
 
 		 638 aa  213  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  47.45 
 
 		 553 aa  212  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 		 855 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  45.82 
 
 		 559 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  43.18 
 
 		 509 aa  211  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  51.12 
 
 		 595 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  41.39 
 
 		 575 aa  208  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  43.91 
 
 		 466 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.27 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.08 
 
 		 532 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  48.58 
 
 		 631 aa  204  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  47.96 
 
 		 507 aa  203  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  49.41 
 
 		 503 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  46.79 
 
 		 650 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  46.83 
 
 		 468 aa  197  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  49.18 
 
 		 476 aa  197  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  46.07 
 
 		 419 aa  196  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  41.58 
 
 		 385 aa  195  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  43.32 
 
 		 391 aa  194  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  48.95 
 
 		 581 aa  193  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  48.41 
 
 		 345 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  52.61 
 
 		 534 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  44.24 
 
 		 296 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  42.81 
 
 		 543 aa  190  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  41.98 
 
 		 493 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5881  serine/threonine protein kinase  47.37 
 
 		 264 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00553777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  46.55 
 
 		 583 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0235  protein kinase  43.86 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.692705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  45.93 
 
 		 660 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  39.41 
 
 		 612 aa  180  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  43.4 
 
 		 621 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  45.76 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  42.47 
 
 		 721 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  50.7 
 
 		 501 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  43.94 
 
 		 482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.76 
 
 		 405 aa  175  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0240  serine/threonine protein kinase  46.34 
 
 		 353 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0229  serine/threonine protein kinase  46.34 
 
 		 353 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0217  serine/threonine protein kinase  46.34 
 
 		 353 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00807707  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  41.98 
 
 		 604 aa  174  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  41.55 
 
 		 625 aa  173  9e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5247  serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1248  serine/threonine protein kinase  45.58 
 
 		 543 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.987546  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  40.79 
 
 		 596 aa  172  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.32 
 
 		 512 aa  171  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  46.19 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.09 
 
 		 579 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  42.2 
 
 		 593 aa  169  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.48 
 
 		 505 aa  168  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  38.71 
 
 		 673 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 		 503 aa  167  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  48.2 
 
 		 564 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  38.57 
 
 		 641 aa  167  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  34.12 
 
 		 692 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  33.73 
 
 		 691 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  39.91 
 
 		 623 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  42.29 
 
 		 556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  38.23 
 
 		 776 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.23 
 
 		 614 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>