More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5936 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1029 aa  1975    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  76.51 
 
 
695 aa  432  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  63.4 
 
 
673 aa  288  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  51.61 
 
 
674 aa  257  6e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  46.11 
 
 
525 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  53.61 
 
 
617 aa  249  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  48.7 
 
 
659 aa  238  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  51.32 
 
 
468 aa  237  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  47.96 
 
 
675 aa  236  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  46.03 
 
 
563 aa  231  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.22 
 
 
678 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  45.95 
 
 
632 aa  229  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  45.19 
 
 
562 aa  227  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  45.08 
 
 
411 aa  226  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  47.83 
 
 
487 aa  225  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  48.47 
 
 
776 aa  225  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.25 
 
 
596 aa  222  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  48.21 
 
 
501 aa  218  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  48.47 
 
 
422 aa  217  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  50.93 
 
 
528 aa  214  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  55.45 
 
 
575 aa  213  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.31 
 
 
521 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.29 
 
 
419 aa  211  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  41.64 
 
 
605 aa  209  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  45.26 
 
 
766 aa  209  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  48.26 
 
 
493 aa  209  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  45.19 
 
 
535 aa  208  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.96 
 
 
532 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  43.98 
 
 
571 aa  206  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  46.13 
 
 
559 aa  206  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
703 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
460 aa  206  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  46.1 
 
 
418 aa  206  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  45.04 
 
 
509 aa  204  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  45.36 
 
 
554 aa  203  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  46.18 
 
 
705 aa  203  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  42.7 
 
 
525 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  49.08 
 
 
419 aa  201  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  48 
 
 
461 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  46.09 
 
 
855 aa  199  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  45.55 
 
 
631 aa  198  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  43.22 
 
 
674 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.93 
 
 
531 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  43.17 
 
 
583 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.39 
 
 
668 aa  193  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  41.72 
 
 
385 aa  192  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.67 
 
 
446 aa  191  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  42.49 
 
 
470 aa  191  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  51.71 
 
 
377 aa  191  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  47.13 
 
 
468 aa  190  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  46.86 
 
 
621 aa  189  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  40.91 
 
 
466 aa  188  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  41.16 
 
 
595 aa  188  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  41.79 
 
 
493 aa  187  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  43.07 
 
 
405 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  41.84 
 
 
721 aa  186  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  46.72 
 
 
638 aa  186  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  43.7 
 
 
553 aa  186  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  37.7 
 
 
691 aa  184  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  43.18 
 
 
391 aa  184  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  44.22 
 
 
534 aa  183  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  47.25 
 
 
532 aa  184  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  38.1 
 
 
692 aa  183  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  46.54 
 
 
507 aa  182  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  43.3 
 
 
556 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  44.4 
 
 
503 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  39.69 
 
 
575 aa  182  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  45.41 
 
 
650 aa  179  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  41.49 
 
 
543 aa  178  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  39.78 
 
 
776 aa  177  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.49 
 
 
512 aa  177  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  46.99 
 
 
345 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  39.41 
 
 
673 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.49 
 
 
650 aa  174  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.18 
 
 
659 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  46.49 
 
 
581 aa  173  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  34.77 
 
 
623 aa  169  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  42.79 
 
 
465 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.47 
 
 
579 aa  169  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.7 
 
 
627 aa  168  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  43.78 
 
 
569 aa  169  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  43.3 
 
 
476 aa  168  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.96 
 
 
505 aa  168  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  43.54 
 
 
482 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  38.93 
 
 
612 aa  167  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  34.77 
 
 
638 aa  167  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  37.15 
 
 
593 aa  167  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  43.72 
 
 
660 aa  166  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.91 
 
 
647 aa  166  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1248  serine/threonine protein kinase  39.41 
 
 
543 aa  166  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.987546  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.05 
 
 
603 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3106  serine/threonine protein kinase  47.76 
 
 
538 aa  164  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.87 
 
 
850 aa  162  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  40.29 
 
 
559 aa  162  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.85 
 
 
602 aa  162  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  39.73 
 
 
625 aa  162  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.15 
 
 
681 aa  161  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  41.74 
 
 
480 aa  161  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  38.7 
 
 
651 aa  160  9e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.84 
 
 
614 aa  160  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>