More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5937 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
617 aa  1186    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  88.92 
 
 
674 aa  530  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  55.73 
 
 
695 aa  277  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  53.7 
 
 
632 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  53.82 
 
 
1029 aa  259  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  51.86 
 
 
673 aa  256  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  56.28 
 
 
678 aa  254  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  50.91 
 
 
563 aa  250  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  49.45 
 
 
525 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  49.25 
 
 
562 aa  243  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  52.45 
 
 
776 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  47.62 
 
 
501 aa  239  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  56.1 
 
 
528 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  50.57 
 
 
468 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  52.87 
 
 
422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  50.2 
 
 
487 aa  235  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  51 
 
 
596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  49.81 
 
 
411 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  48.64 
 
 
659 aa  225  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  49.58 
 
 
419 aa  224  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  44.97 
 
 
766 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.32 
 
 
521 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.21 
 
 
531 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  46.26 
 
 
675 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  44.94 
 
 
535 aa  221  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  50.24 
 
 
418 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  44.32 
 
 
525 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  49.38 
 
 
461 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  49.78 
 
 
493 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  50.41 
 
 
377 aa  217  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
703 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  55.66 
 
 
575 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.91 
 
 
532 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  43.64 
 
 
571 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  43.94 
 
 
509 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  45.42 
 
 
674 aa  213  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  43.22 
 
 
575 aa  212  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.74 
 
 
668 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  48.48 
 
 
460 aa  209  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  47.45 
 
 
553 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  50.8 
 
 
621 aa  209  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  48.41 
 
 
705 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  51.42 
 
 
638 aa  207  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  48.83 
 
 
470 aa  207  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  43.4 
 
 
554 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  44.65 
 
 
466 aa  204  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  47.25 
 
 
650 aa  203  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  45.02 
 
 
559 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  48.33 
 
 
507 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  47.92 
 
 
503 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  44.85 
 
 
855 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.67 
 
 
446 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  50.67 
 
 
595 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  47.77 
 
 
631 aa  196  8.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  49.59 
 
 
476 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  41.42 
 
 
385 aa  194  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  47.01 
 
 
419 aa  193  9e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  45.35 
 
 
296 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  44.98 
 
 
391 aa  192  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  45.14 
 
 
468 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  41.97 
 
 
543 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  48.16 
 
 
534 aa  188  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  47.26 
 
 
581 aa  187  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5881  serine/threonine protein kinase  48.18 
 
 
264 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00553777  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 
493 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  48.41 
 
 
345 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  46.77 
 
 
532 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  46.12 
 
 
583 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  46.34 
 
 
660 aa  176  8e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0235  protein kinase  43.42 
 
 
352 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.692705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
721 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  36.51 
 
 
612 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1248  serine/threonine protein kinase  44.14 
 
 
543 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.987546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.67 
 
 
512 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.29 
 
 
405 aa  171  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  47.6 
 
 
501 aa  170  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  41.98 
 
 
621 aa  170  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  41.51 
 
 
604 aa  167  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  47.64 
 
 
482 aa  167  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0240  serine/threonine protein kinase  45.85 
 
 
353 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0229  serine/threonine protein kinase  45.85 
 
 
353 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0217  serine/threonine protein kinase  45.85 
 
 
353 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00807707  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  38.02 
 
 
596 aa  166  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  45.71 
 
 
481 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.21 
 
 
579 aa  165  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  37.44 
 
 
641 aa  165  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  39.91 
 
 
623 aa  165  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
625 aa  163  8.000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  43.18 
 
 
556 aa  163  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  41.28 
 
 
593 aa  163  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.74 
 
 
591 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.64 
 
 
602 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5247  serine/threonine protein kinase  40.87 
 
 
498 aa  161  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592329 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.14 
 
 
551 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  34.65 
 
 
692 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  38.5 
 
 
651 aa  160  8e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.81 
 
 
499 aa  160  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  41.23 
 
 
503 aa  160  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40 
 
 
505 aa  160  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  37.74 
 
 
634 aa  159  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>