More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2140 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
532 aa  1061    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  58.5 
 
 
446 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  62.63 
 
 
503 aa  319  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  57.6 
 
 
703 aa  296  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  54.74 
 
 
556 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  51.65 
 
 
776 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3106  serine/threonine protein kinase  61.36 
 
 
538 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  49.82 
 
 
659 aa  249  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  51.39 
 
 
660 aa  249  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  50.94 
 
 
468 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  52.04 
 
 
528 aa  249  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  48.99 
 
 
525 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  49.64 
 
 
705 aa  246  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  48.32 
 
 
632 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  56.45 
 
 
962 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  49.29 
 
 
534 aa  244  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  52.22 
 
 
521 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
631 aa  243  7.999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  50.19 
 
 
411 aa  243  7.999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  47.64 
 
 
675 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  47.92 
 
 
674 aa  239  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  51.19 
 
 
468 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.27 
 
 
678 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.79 
 
 
596 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.45 
 
 
531 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  53.51 
 
 
650 aa  236  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  51.09 
 
 
460 aa  232  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.06 
 
 
532 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  44.7 
 
 
487 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  46.38 
 
 
766 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  49.08 
 
 
470 aa  229  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  47.83 
 
 
543 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  46.44 
 
 
418 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.67 
 
 
419 aa  228  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  52.38 
 
 
575 aa  227  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  45.86 
 
 
563 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.85 
 
 
562 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  50.95 
 
 
621 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  49.41 
 
 
461 aa  224  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.93 
 
 
668 aa  223  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  48.99 
 
 
422 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  41.36 
 
 
595 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  46.62 
 
 
377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  46.42 
 
 
493 aa  216  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 
554 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  44.36 
 
 
501 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  49.62 
 
 
638 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  45.64 
 
 
1029 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  40.09 
 
 
581 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  43.73 
 
 
575 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  48.11 
 
 
507 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  46.45 
 
 
583 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  45.88 
 
 
674 aa  207  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  48.44 
 
 
564 aa  207  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.62 
 
 
659 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  44.04 
 
 
695 aa  205  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  44.19 
 
 
673 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  43.38 
 
 
553 aa  204  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.51 
 
 
512 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  47.04 
 
 
617 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  41.44 
 
 
855 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  42.64 
 
 
571 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  43.49 
 
 
501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  44.78 
 
 
466 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  38.66 
 
 
525 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  41.86 
 
 
509 aa  193  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  38.62 
 
 
385 aa  191  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  46.57 
 
 
391 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  39.34 
 
 
596 aa  188  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  41.83 
 
 
605 aa  188  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  40.22 
 
 
535 aa  186  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  40.44 
 
 
559 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  40.82 
 
 
468 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  44.98 
 
 
345 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.08 
 
 
405 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  40.53 
 
 
646 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  40.58 
 
 
493 aa  184  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  37.22 
 
 
612 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 
691 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3705  protein kinase  44.44 
 
 
449 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424517  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  34.49 
 
 
703 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  40.97 
 
 
296 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  34.3 
 
 
692 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.35 
 
 
598 aa  181  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  35.81 
 
 
612 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.8 
 
 
641 aa  177  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  30.69 
 
 
664 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  30.69 
 
 
664 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  40.64 
 
 
517 aa  177  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.22 
 
 
757 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  42.05 
 
 
497 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  37.28 
 
 
651 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.59 
 
 
591 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  45.35 
 
 
476 aa  173  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  42.96 
 
 
482 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  32.68 
 
 
593 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  43.08 
 
 
533 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.58 
 
 
518 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  39.15 
 
 
666 aa  170  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  35.38 
 
 
638 aa  170  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>