More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4070 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
673 aa  1281    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  61.98 
 
 
695 aa  301  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  63.4 
 
 
1029 aa  294  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  52.03 
 
 
674 aa  270  7e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  51.86 
 
 
617 aa  253  8.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
525 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  50.56 
 
 
468 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.69 
 
 
596 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  44.72 
 
 
562 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  54.48 
 
 
528 aa  240  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  49.62 
 
 
659 aa  240  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  49.62 
 
 
411 aa  240  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  49.27 
 
 
675 aa  239  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.54 
 
 
678 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.81 
 
 
531 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.88 
 
 
419 aa  230  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  49.81 
 
 
422 aa  229  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  48.36 
 
 
563 aa  228  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  44.33 
 
 
571 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  48.31 
 
 
632 aa  224  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  46.79 
 
 
776 aa  224  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  46.15 
 
 
605 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  43.87 
 
 
855 aa  223  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  45.93 
 
 
535 aa  223  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  47.19 
 
 
674 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  46.64 
 
 
418 aa  221  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.57 
 
 
521 aa  220  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  46.42 
 
 
509 aa  219  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  45.69 
 
 
766 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.89 
 
 
668 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  43.82 
 
 
575 aa  215  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  46.49 
 
 
559 aa  213  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.45 
 
 
446 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  45.56 
 
 
487 aa  212  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  45.59 
 
 
501 aa  212  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  43.48 
 
 
525 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  49 
 
 
461 aa  211  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  45.08 
 
 
703 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  45.49 
 
 
553 aa  209  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  48.08 
 
 
595 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  50.96 
 
 
621 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  49.82 
 
 
460 aa  207  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  51.12 
 
 
507 aa  207  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  50.18 
 
 
419 aa  206  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  51.38 
 
 
575 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  46.4 
 
 
470 aa  204  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  44.8 
 
 
554 aa  204  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.55 
 
 
532 aa  203  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.37 
 
 
659 aa  203  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  47.1 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  46.79 
 
 
391 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  49.62 
 
 
581 aa  201  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  46.56 
 
 
705 aa  200  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  49.81 
 
 
638 aa  200  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  46.97 
 
 
377 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  37.73 
 
 
466 aa  196  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  43.33 
 
 
583 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  47.06 
 
 
631 aa  195  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  42.55 
 
 
405 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  46.67 
 
 
493 aa  191  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  41.94 
 
 
385 aa  187  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  37.91 
 
 
612 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  45.63 
 
 
503 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  39.42 
 
 
543 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  45.83 
 
 
532 aa  184  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 
721 aa  184  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  46.22 
 
 
660 aa  183  9.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  40.84 
 
 
621 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  41.61 
 
 
493 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  44.75 
 
 
650 aa  181  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  45.65 
 
 
476 aa  180  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.16 
 
 
632 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  42.69 
 
 
534 aa  177  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  43.3 
 
 
646 aa  177  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  46.27 
 
 
556 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  42.32 
 
 
296 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  46.39 
 
 
482 aa  174  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  36.7 
 
 
673 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.91 
 
 
681 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.18 
 
 
603 aa  171  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.28 
 
 
512 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  37.82 
 
 
776 aa  170  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  34.87 
 
 
691 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  32.76 
 
 
638 aa  169  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0235  protein kinase  41.2 
 
 
352 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.692705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1248  serine/threonine protein kinase  41.7 
 
 
543 aa  168  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.987546  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 
596 aa  167  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  41.33 
 
 
618 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.93 
 
 
579 aa  167  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  43.7 
 
 
345 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  36.1 
 
 
615 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.85 
 
 
647 aa  166  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  35.25 
 
 
692 aa  166  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0811  protein kinase  44.3 
 
 
436 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.630779 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.44 
 
 
627 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  40.59 
 
 
480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  38.26 
 
 
623 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  38.38 
 
 
582 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  40.89 
 
 
609 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  35.99 
 
 
625 aa  165  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>