More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3766 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
571 aa  1132    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  61.63 
 
 
553 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  51.27 
 
 
855 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  54.98 
 
 
466 aa  282  9e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  54.69 
 
 
509 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  53 
 
 
554 aa  273  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  53.36 
 
 
575 aa  270  8e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  45.95 
 
 
405 aa  266  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  48.42 
 
 
385 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  52.51 
 
 
493 aa  250  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  49.81 
 
 
776 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  45.28 
 
 
695 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  48.29 
 
 
411 aa  222  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  43.24 
 
 
419 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  44.6 
 
 
525 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  45.19 
 
 
605 aa  217  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  42.26 
 
 
562 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  44.57 
 
 
535 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  46.59 
 
 
419 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  46.39 
 
 
659 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  46.42 
 
 
528 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.05 
 
 
596 aa  213  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  43.67 
 
 
563 aa  212  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  45.63 
 
 
675 aa  212  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  44.33 
 
 
673 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  43.4 
 
 
418 aa  211  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  44.66 
 
 
638 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  44.65 
 
 
674 aa  209  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  44.66 
 
 
621 aa  206  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  43.24 
 
 
632 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  43.43 
 
 
596 aa  204  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.58 
 
 
668 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  43.94 
 
 
1029 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  43.51 
 
 
487 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  44.49 
 
 
468 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  45.2 
 
 
461 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  41.06 
 
 
612 aa  200  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.28 
 
 
678 aa  200  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.05 
 
 
521 aa  199  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  42.31 
 
 
422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  43.23 
 
 
673 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  35.17 
 
 
776 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  42.24 
 
 
766 aa  198  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  42.7 
 
 
377 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.53 
 
 
627 aa  196  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  40.53 
 
 
501 aa  196  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.97 
 
 
659 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  47.24 
 
 
595 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  43.64 
 
 
617 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  42.35 
 
 
583 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  44.7 
 
 
631 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  46.33 
 
 
1655 aa  194  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  43.75 
 
 
468 aa  194  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 
691 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.54 
 
 
532 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  43.4 
 
 
674 aa  192  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0036  serine/threonine protein kinase  41.13 
 
 
614 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  34.19 
 
 
692 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  41.44 
 
 
625 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  38.22 
 
 
638 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.75 
 
 
652 aa  189  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  45.06 
 
 
705 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  41.03 
 
 
525 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.07 
 
 
627 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  44.53 
 
 
345 aa  188  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.98 
 
 
446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0026  serine/threonine protein kinase  44.78 
 
 
444 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 
666 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.45 
 
 
662 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  44.5 
 
 
320 aa  184  4.0000000000000006e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  43.69 
 
 
503 aa  184  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  42.99 
 
 
593 aa  184  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.13 
 
 
505 aa  184  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.35 
 
 
715 aa  183  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  44.8 
 
 
316 aa  183  8.000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.99 
 
 
579 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  44.74 
 
 
470 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  41.15 
 
 
703 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2079  serine/threonine protein kinase  43.72 
 
 
503 aa  181  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  44.09 
 
 
482 aa  181  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  42.16 
 
 
460 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.7 
 
 
650 aa  181  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
723 aa  180  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  43.58 
 
 
517 aa  180  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  40.49 
 
 
721 aa  180  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.6 
 
 
562 aa  179  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  45.28 
 
 
660 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  40.4 
 
 
503 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  42.38 
 
 
391 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 
612 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.2 
 
 
657 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  41.7 
 
 
646 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.4 
 
 
620 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  42.07 
 
 
507 aa  178  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  41.98 
 
 
382 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.37 
 
 
632 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  37.12 
 
 
951 aa  177  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26980  serine/threonine protein kinase  43.17 
 
 
538 aa  177  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.07 
 
 
531 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.08 
 
 
591 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>